Protein–RNA interactions for Protein: Q60790

Rasa3, Ras GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa3Q60790 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rasa3Q60790 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rasa3Q60790 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rasa3Q60790 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rasa3Q60790 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rasa3Q60790 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rasa3Q60790 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rasa3Q60790 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rasa3Q60790 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rasa3Q60790 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rasa3Q60790 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rasa3Q60790 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rasa3Q60790 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rasa3Q60790 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rasa3Q60790 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rasa3Q60790 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rasa3Q60790 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rasa3Q60790 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rasa3Q60790 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rasa3Q60790 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rasa3Q60790 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rasa3Q60790 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rasa3Q60790 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rasa3Q60790 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rasa3Q60790 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rasa3Q60790 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rasa3Q60790 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rasa3Q60790 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rasa3Q60790 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rasa3Q60790 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Rasa3Q60790 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rasa3Q60790 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rasa3Q60790 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rasa3Q60790 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rasa3Q60790 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rasa3Q60790 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rasa3Q60790 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rasa3Q60790 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Rasa3Q60790 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rasa3Q60790 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rasa3Q60790 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rasa3Q60790 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rasa3Q60790 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rasa3Q60790 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rasa3Q60790 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rasa3Q60790 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rasa3Q60790 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rasa3Q60790 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rasa3Q60790 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rasa3Q60790 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rasa3Q60790 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Rasa3Q60790 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rasa3Q60790 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rasa3Q60790 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rasa3Q60790 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rasa3Q60790 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rasa3Q60790 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rasa3Q60790 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rasa3Q60790 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rasa3Q60790 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rasa3Q60790 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rasa3Q60790 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rasa3Q60790 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Rasa3Q60790 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rasa3Q60790 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rasa3Q60790 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rasa3Q60790 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rasa3Q60790 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rasa3Q60790 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rasa3Q60790 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rasa3Q60790 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rasa3Q60790 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Rasa3Q60790 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rasa3Q60790 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rasa3Q60790 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Rasa3Q60790 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Rasa3Q60790 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rasa3Q60790 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rasa3Q60790 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rasa3Q60790 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rasa3Q60790 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rasa3Q60790 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rasa3Q60790 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rasa3Q60790 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rasa3Q60790 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Rasa3Q60790 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rasa3Q60790 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rasa3Q60790 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rasa3Q60790 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rasa3Q60790 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rasa3Q60790 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rasa3Q60790 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rasa3Q60790 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rasa3Q60790 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rasa3Q60790 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rasa3Q60790 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rasa3Q60790 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rasa3Q60790 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rasa3Q60790 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rasa3Q60790 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms