Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf15Q5UBV8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf15Q5UBV8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf15Q5UBV8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf15Q5UBV8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf15Q5UBV8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf15Q5UBV8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf15Q5UBV8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf15Q5UBV8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf15Q5UBV8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf15Q5UBV8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf15Q5UBV8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfsf15Q5UBV8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf15Q5UBV8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf15Q5UBV8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf15Q5UBV8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf15Q5UBV8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf15Q5UBV8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf15Q5UBV8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf15Q5UBV8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms