Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PkdccQ5RJI4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PkdccQ5RJI4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PkdccQ5RJI4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PkdccQ5RJI4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PkdccQ5RJI4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PkdccQ5RJI4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PkdccQ5RJI4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PkdccQ5RJI4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PkdccQ5RJI4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PkdccQ5RJI4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PkdccQ5RJI4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PkdccQ5RJI4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PkdccQ5RJI4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PkdccQ5RJI4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PkdccQ5RJI4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PkdccQ5RJI4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PkdccQ5RJI4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PkdccQ5RJI4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PkdccQ5RJI4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PkdccQ5RJI4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PkdccQ5RJI4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PkdccQ5RJI4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PkdccQ5RJI4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PkdccQ5RJI4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PkdccQ5RJI4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PkdccQ5RJI4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PkdccQ5RJI4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PkdccQ5RJI4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PkdccQ5RJI4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PkdccQ5RJI4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PkdccQ5RJI4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PkdccQ5RJI4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PkdccQ5RJI4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PkdccQ5RJI4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PkdccQ5RJI4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PkdccQ5RJI4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PkdccQ5RJI4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PkdccQ5RJI4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PkdccQ5RJI4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PkdccQ5RJI4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PkdccQ5RJI4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PkdccQ5RJI4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PkdccQ5RJI4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PkdccQ5RJI4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PkdccQ5RJI4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PkdccQ5RJI4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PkdccQ5RJI4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PkdccQ5RJI4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PkdccQ5RJI4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PkdccQ5RJI4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PkdccQ5RJI4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PkdccQ5RJI4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PkdccQ5RJI4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PkdccQ5RJI4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PkdccQ5RJI4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PkdccQ5RJI4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PkdccQ5RJI4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PkdccQ5RJI4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PkdccQ5RJI4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PkdccQ5RJI4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PkdccQ5RJI4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PkdccQ5RJI4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PkdccQ5RJI4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PkdccQ5RJI4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PkdccQ5RJI4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PkdccQ5RJI4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PkdccQ5RJI4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PkdccQ5RJI4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PkdccQ5RJI4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PkdccQ5RJI4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PkdccQ5RJI4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PkdccQ5RJI4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PkdccQ5RJI4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PkdccQ5RJI4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PkdccQ5RJI4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PkdccQ5RJI4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PkdccQ5RJI4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PkdccQ5RJI4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PkdccQ5RJI4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PkdccQ5RJI4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PkdccQ5RJI4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PkdccQ5RJI4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PkdccQ5RJI4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PkdccQ5RJI4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PkdccQ5RJI4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PkdccQ5RJI4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PkdccQ5RJI4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PkdccQ5RJI4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PkdccQ5RJI4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PkdccQ5RJI4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PkdccQ5RJI4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PkdccQ5RJI4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PkdccQ5RJI4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PkdccQ5RJI4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PkdccQ5RJI4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PkdccQ5RJI4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PkdccQ5RJI4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PkdccQ5RJI4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PkdccQ5RJI4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
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