Protein–RNA interactions for Protein: Q5QNQ9

Col27a1, Collagen alpha-1(XXVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col27a1Q5QNQ9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col27a1Q5QNQ9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col27a1Q5QNQ9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Col27a1Q5QNQ9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col27a1Q5QNQ9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col27a1Q5QNQ9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col27a1Q5QNQ9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col27a1Q5QNQ9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col27a1Q5QNQ9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Col27a1Q5QNQ9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Col27a1Q5QNQ9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col27a1Q5QNQ9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col27a1Q5QNQ9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col27a1Q5QNQ9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col27a1Q5QNQ9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col27a1Q5QNQ9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col27a1Q5QNQ9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Col27a1Q5QNQ9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Col27a1Q5QNQ9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col27a1Q5QNQ9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col27a1Q5QNQ9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col27a1Q5QNQ9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col27a1Q5QNQ9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col27a1Q5QNQ9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col27a1Q5QNQ9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col27a1Q5QNQ9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col27a1Q5QNQ9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col27a1Q5QNQ9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col27a1Q5QNQ9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col27a1Q5QNQ9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col27a1Q5QNQ9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col27a1Q5QNQ9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col27a1Q5QNQ9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col27a1Q5QNQ9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Col27a1Q5QNQ9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col27a1Q5QNQ9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col27a1Q5QNQ9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Col27a1Q5QNQ9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col27a1Q5QNQ9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col27a1Q5QNQ9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Col27a1Q5QNQ9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Col27a1Q5QNQ9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Col27a1Q5QNQ9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col27a1Q5QNQ9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col27a1Q5QNQ9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Col27a1Q5QNQ9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col27a1Q5QNQ9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col27a1Q5QNQ9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col27a1Q5QNQ9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col27a1Q5QNQ9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col27a1Q5QNQ9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col27a1Q5QNQ9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col27a1Q5QNQ9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col27a1Q5QNQ9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Col27a1Q5QNQ9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col27a1Q5QNQ9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col27a1Q5QNQ9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col27a1Q5QNQ9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col27a1Q5QNQ9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Col27a1Q5QNQ9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col27a1Q5QNQ9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Col27a1Q5QNQ9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col27a1Q5QNQ9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col27a1Q5QNQ9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col27a1Q5QNQ9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col27a1Q5QNQ9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col27a1Q5QNQ9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col27a1Q5QNQ9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Col27a1Q5QNQ9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Col27a1Q5QNQ9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Col27a1Q5QNQ9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col27a1Q5QNQ9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col27a1Q5QNQ9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col27a1Q5QNQ9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col27a1Q5QNQ9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col27a1Q5QNQ9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col27a1Q5QNQ9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col27a1Q5QNQ9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col27a1Q5QNQ9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col27a1Q5QNQ9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col27a1Q5QNQ9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col27a1Q5QNQ9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col27a1Q5QNQ9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col27a1Q5QNQ9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col27a1Q5QNQ9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col27a1Q5QNQ9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col27a1Q5QNQ9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col27a1Q5QNQ9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Col27a1Q5QNQ9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col27a1Q5QNQ9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col27a1Q5QNQ9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Col27a1Q5QNQ9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col27a1Q5QNQ9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col27a1Q5QNQ9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col27a1Q5QNQ9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Col27a1Q5QNQ9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Col27a1Q5QNQ9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col27a1Q5QNQ9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col27a1Q5QNQ9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Col27a1Q5QNQ9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.8 ms