Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ecm2Q5FW85 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ecm2Q5FW85 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ecm2Q5FW85 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ecm2Q5FW85 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ecm2Q5FW85 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ecm2Q5FW85 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ecm2Q5FW85 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Ecm2Q5FW85 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Ecm2Q5FW85 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ecm2Q5FW85 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ecm2Q5FW85 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ecm2Q5FW85 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ecm2Q5FW85 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ecm2Q5FW85 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ecm2Q5FW85 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ecm2Q5FW85 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Ecm2Q5FW85 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ecm2Q5FW85 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ecm2Q5FW85 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ecm2Q5FW85 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ecm2Q5FW85 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ecm2Q5FW85 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ecm2Q5FW85 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ecm2Q5FW85 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ecm2Q5FW85 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Ecm2Q5FW85 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ecm2Q5FW85 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ecm2Q5FW85 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ecm2Q5FW85 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ecm2Q5FW85 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ecm2Q5FW85 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ecm2Q5FW85 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ecm2Q5FW85 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ecm2Q5FW85 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ecm2Q5FW85 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ecm2Q5FW85 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Ecm2Q5FW85 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Ecm2Q5FW85 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ecm2Q5FW85 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ecm2Q5FW85 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ecm2Q5FW85 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ecm2Q5FW85 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ecm2Q5FW85 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ecm2Q5FW85 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ecm2Q5FW85 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ecm2Q5FW85 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ecm2Q5FW85 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ecm2Q5FW85 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ecm2Q5FW85 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ecm2Q5FW85 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ecm2Q5FW85 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ecm2Q5FW85 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Ecm2Q5FW85 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ecm2Q5FW85 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Ecm2Q5FW85 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ecm2Q5FW85 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ecm2Q5FW85 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ecm2Q5FW85 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ecm2Q5FW85 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ecm2Q5FW85 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ecm2Q5FW85 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ecm2Q5FW85 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ecm2Q5FW85 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ecm2Q5FW85 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ecm2Q5FW85 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ecm2Q5FW85 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ecm2Q5FW85 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Ecm2Q5FW85 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ecm2Q5FW85 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ecm2Q5FW85 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ecm2Q5FW85 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Ecm2Q5FW85 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ecm2Q5FW85 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ecm2Q5FW85 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ecm2Q5FW85 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ecm2Q5FW85 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ecm2Q5FW85 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ecm2Q5FW85 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ecm2Q5FW85 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ecm2Q5FW85 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ecm2Q5FW85 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Ecm2Q5FW85 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ecm2Q5FW85 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ecm2Q5FW85 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ecm2Q5FW85 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ecm2Q5FW85 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ecm2Q5FW85 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ecm2Q5FW85 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ecm2Q5FW85 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Ecm2Q5FW85 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ecm2Q5FW85 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ecm2Q5FW85 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Ecm2Q5FW85 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Ecm2Q5FW85 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ecm2Q5FW85 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ecm2Q5FW85 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ecm2Q5FW85 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Ecm2Q5FW85 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ecm2Q5FW85 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms