Protein–RNA interactions for Protein: Q50H33

Kctd8, BTB/POZ domain-containing protein KCTD8, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd8Q50H33 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kctd8Q50H33 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kctd8Q50H33 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kctd8Q50H33 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Kctd8Q50H33 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kctd8Q50H33 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kctd8Q50H33 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kctd8Q50H33 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kctd8Q50H33 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kctd8Q50H33 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kctd8Q50H33 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kctd8Q50H33 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kctd8Q50H33 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kctd8Q50H33 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kctd8Q50H33 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kctd8Q50H33 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kctd8Q50H33 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kctd8Q50H33 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Kctd8Q50H33 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kctd8Q50H33 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kctd8Q50H33 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kctd8Q50H33 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kctd8Q50H33 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kctd8Q50H33 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kctd8Q50H33 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kctd8Q50H33 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kctd8Q50H33 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kctd8Q50H33 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kctd8Q50H33 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kctd8Q50H33 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kctd8Q50H33 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kctd8Q50H33 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kctd8Q50H33 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kctd8Q50H33 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kctd8Q50H33 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Kctd8Q50H33 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kctd8Q50H33 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kctd8Q50H33 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Kctd8Q50H33 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kctd8Q50H33 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kctd8Q50H33 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kctd8Q50H33 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kctd8Q50H33 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kctd8Q50H33 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kctd8Q50H33 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kctd8Q50H33 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kctd8Q50H33 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kctd8Q50H33 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kctd8Q50H33 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kctd8Q50H33 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kctd8Q50H33 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kctd8Q50H33 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kctd8Q50H33 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kctd8Q50H33 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kctd8Q50H33 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kctd8Q50H33 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kctd8Q50H33 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kctd8Q50H33 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kctd8Q50H33 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kctd8Q50H33 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kctd8Q50H33 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Kctd8Q50H33 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kctd8Q50H33 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kctd8Q50H33 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kctd8Q50H33 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kctd8Q50H33 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kctd8Q50H33 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kctd8Q50H33 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kctd8Q50H33 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kctd8Q50H33 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kctd8Q50H33 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kctd8Q50H33 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kctd8Q50H33 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kctd8Q50H33 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kctd8Q50H33 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kctd8Q50H33 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kctd8Q50H33 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kctd8Q50H33 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kctd8Q50H33 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kctd8Q50H33 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kctd8Q50H33 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kctd8Q50H33 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kctd8Q50H33 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kctd8Q50H33 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kctd8Q50H33 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kctd8Q50H33 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kctd8Q50H33 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kctd8Q50H33 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kctd8Q50H33 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Kctd8Q50H33 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kctd8Q50H33 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kctd8Q50H33 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kctd8Q50H33 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kctd8Q50H33 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kctd8Q50H33 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kctd8Q50H33 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kctd8Q50H33 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kctd8Q50H33 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kctd8Q50H33 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kctd8Q50H33 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms