Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp235Q499D5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp235Q499D5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp235Q499D5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp235Q499D5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp235Q499D5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp235Q499D5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zfp235Q499D5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zfp235Q499D5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp235Q499D5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp235Q499D5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp235Q499D5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp235Q499D5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp235Q499D5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp235Q499D5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp235Q499D5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp235Q499D5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp235Q499D5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp235Q499D5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp235Q499D5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp235Q499D5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp235Q499D5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp235Q499D5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp235Q499D5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp235Q499D5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp235Q499D5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp235Q499D5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp235Q499D5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp235Q499D5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp235Q499D5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp235Q499D5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp235Q499D5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp235Q499D5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp235Q499D5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp235Q499D5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp235Q499D5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp235Q499D5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp235Q499D5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp235Q499D5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp235Q499D5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp235Q499D5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp235Q499D5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp235Q499D5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp235Q499D5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp235Q499D5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp235Q499D5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp235Q499D5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp235Q499D5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp235Q499D5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp235Q499D5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp235Q499D5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp235Q499D5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp235Q499D5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp235Q499D5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp235Q499D5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp235Q499D5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp235Q499D5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp235Q499D5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp235Q499D5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp235Q499D5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp235Q499D5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp235Q499D5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp235Q499D5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp235Q499D5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp235Q499D5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp235Q499D5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp235Q499D5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp235Q499D5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp235Q499D5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp235Q499D5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp235Q499D5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp235Q499D5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp235Q499D5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp235Q499D5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp235Q499D5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp235Q499D5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp235Q499D5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp235Q499D5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp235Q499D5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp235Q499D5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp235Q499D5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp235Q499D5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp235Q499D5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp235Q499D5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp235Q499D5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zfp235Q499D5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp235Q499D5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp235Q499D5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp235Q499D5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp235Q499D5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp235Q499D5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp235Q499D5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp235Q499D5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp235Q499D5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp235Q499D5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp235Q499D5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp235Q499D5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp235Q499D5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp235Q499D5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp235Q499D5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms