Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pacs2Q3V3Q7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pacs2Q3V3Q7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pacs2Q3V3Q7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pacs2Q3V3Q7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pacs2Q3V3Q7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pacs2Q3V3Q7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pacs2Q3V3Q7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pacs2Q3V3Q7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pacs2Q3V3Q7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pacs2Q3V3Q7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pacs2Q3V3Q7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pacs2Q3V3Q7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pacs2Q3V3Q7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pacs2Q3V3Q7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pacs2Q3V3Q7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pacs2Q3V3Q7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pacs2Q3V3Q7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pacs2Q3V3Q7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pacs2Q3V3Q7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pacs2Q3V3Q7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pacs2Q3V3Q7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pacs2Q3V3Q7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pacs2Q3V3Q7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pacs2Q3V3Q7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pacs2Q3V3Q7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pacs2Q3V3Q7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pacs2Q3V3Q7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pacs2Q3V3Q7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pacs2Q3V3Q7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pacs2Q3V3Q7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pacs2Q3V3Q7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pacs2Q3V3Q7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pacs2Q3V3Q7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pacs2Q3V3Q7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pacs2Q3V3Q7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pacs2Q3V3Q7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pacs2Q3V3Q7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pacs2Q3V3Q7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pacs2Q3V3Q7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pacs2Q3V3Q7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pacs2Q3V3Q7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pacs2Q3V3Q7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pacs2Q3V3Q7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pacs2Q3V3Q7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pacs2Q3V3Q7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pacs2Q3V3Q7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pacs2Q3V3Q7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pacs2Q3V3Q7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pacs2Q3V3Q7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pacs2Q3V3Q7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pacs2Q3V3Q7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pacs2Q3V3Q7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pacs2Q3V3Q7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pacs2Q3V3Q7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pacs2Q3V3Q7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pacs2Q3V3Q7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pacs2Q3V3Q7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pacs2Q3V3Q7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pacs2Q3V3Q7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pacs2Q3V3Q7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pacs2Q3V3Q7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pacs2Q3V3Q7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pacs2Q3V3Q7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pacs2Q3V3Q7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pacs2Q3V3Q7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pacs2Q3V3Q7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pacs2Q3V3Q7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pacs2Q3V3Q7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pacs2Q3V3Q7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pacs2Q3V3Q7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pacs2Q3V3Q7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pacs2Q3V3Q7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pacs2Q3V3Q7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pacs2Q3V3Q7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pacs2Q3V3Q7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pacs2Q3V3Q7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pacs2Q3V3Q7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pacs2Q3V3Q7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pacs2Q3V3Q7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pacs2Q3V3Q7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pacs2Q3V3Q7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pacs2Q3V3Q7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pacs2Q3V3Q7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pacs2Q3V3Q7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pacs2Q3V3Q7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pacs2Q3V3Q7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pacs2Q3V3Q7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pacs2Q3V3Q7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pacs2Q3V3Q7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pacs2Q3V3Q7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pacs2Q3V3Q7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pacs2Q3V3Q7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pacs2Q3V3Q7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pacs2Q3V3Q7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pacs2Q3V3Q7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pacs2Q3V3Q7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.3 ms