Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dnah12Q3V0Q1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dnah12Q3V0Q1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dnah12Q3V0Q1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dnah12Q3V0Q1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dnah12Q3V0Q1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dnah12Q3V0Q1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dnah12Q3V0Q1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dnah12Q3V0Q1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dnah12Q3V0Q1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dnah12Q3V0Q1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dnah12Q3V0Q1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dnah12Q3V0Q1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dnah12Q3V0Q1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Dnah12Q3V0Q1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dnah12Q3V0Q1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dnah12Q3V0Q1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dnah12Q3V0Q1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dnah12Q3V0Q1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dnah12Q3V0Q1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dnah12Q3V0Q1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dnah12Q3V0Q1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dnah12Q3V0Q1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dnah12Q3V0Q1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dnah12Q3V0Q1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dnah12Q3V0Q1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dnah12Q3V0Q1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dnah12Q3V0Q1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Dnah12Q3V0Q1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dnah12Q3V0Q1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dnah12Q3V0Q1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dnah12Q3V0Q1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dnah12Q3V0Q1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dnah12Q3V0Q1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Dnah12Q3V0Q1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Dnah12Q3V0Q1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dnah12Q3V0Q1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dnah12Q3V0Q1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Dnah12Q3V0Q1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Dnah12Q3V0Q1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnah12Q3V0Q1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnah12Q3V0Q1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnah12Q3V0Q1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dnah12Q3V0Q1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dnah12Q3V0Q1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnah12Q3V0Q1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnah12Q3V0Q1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnah12Q3V0Q1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnah12Q3V0Q1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnah12Q3V0Q1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dnah12Q3V0Q1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dnah12Q3V0Q1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dnah12Q3V0Q1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dnah12Q3V0Q1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dnah12Q3V0Q1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dnah12Q3V0Q1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnah12Q3V0Q1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnah12Q3V0Q1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnah12Q3V0Q1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnah12Q3V0Q1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnah12Q3V0Q1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnah12Q3V0Q1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnah12Q3V0Q1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnah12Q3V0Q1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnah12Q3V0Q1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnah12Q3V0Q1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnah12Q3V0Q1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnah12Q3V0Q1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnah12Q3V0Q1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnah12Q3V0Q1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Dnah12Q3V0Q1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dnah12Q3V0Q1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dnah12Q3V0Q1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dnah12Q3V0Q1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Dnah12Q3V0Q1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dnah12Q3V0Q1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dnah12Q3V0Q1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dnah12Q3V0Q1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnah12Q3V0Q1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnah12Q3V0Q1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnah12Q3V0Q1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnah12Q3V0Q1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnah12Q3V0Q1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnah12Q3V0Q1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnah12Q3V0Q1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Dnah12Q3V0Q1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dnah12Q3V0Q1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dnah12Q3V0Q1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dnah12Q3V0Q1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnah12Q3V0Q1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnah12Q3V0Q1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnah12Q3V0Q1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnah12Q3V0Q1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnah12Q3V0Q1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnah12Q3V0Q1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnah12Q3V0Q1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnah12Q3V0Q1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnah12Q3V0Q1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnah12Q3V0Q1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnah12Q3V0Q1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms