Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccdc27Q3V036 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccdc27Q3V036 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccdc27Q3V036 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc27Q3V036 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc27Q3V036 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc27Q3V036 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc27Q3V036 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccdc27Q3V036 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccdc27Q3V036 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccdc27Q3V036 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccdc27Q3V036 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccdc27Q3V036 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccdc27Q3V036 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccdc27Q3V036 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccdc27Q3V036 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc27Q3V036 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccdc27Q3V036 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc27Q3V036 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc27Q3V036 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc27Q3V036 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc27Q3V036 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc27Q3V036 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc27Q3V036 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc27Q3V036 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc27Q3V036 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc27Q3V036 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc27Q3V036 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc27Q3V036 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Ccdc27Q3V036 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Ccdc27Q3V036 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Ccdc27Q3V036 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ccdc27Q3V036 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ccdc27Q3V036 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ccdc27Q3V036 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc27Q3V036 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc27Q3V036 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccdc27Q3V036 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccdc27Q3V036 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc27Q3V036 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc27Q3V036 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc27Q3V036 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc27Q3V036 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc27Q3V036 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc27Q3V036 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc27Q3V036 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc27Q3V036 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc27Q3V036 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc27Q3V036 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc27Q3V036 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc27Q3V036 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc27Q3V036 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc27Q3V036 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc27Q3V036 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc27Q3V036 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc27Q3V036 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc27Q3V036 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc27Q3V036 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc27Q3V036 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc27Q3V036 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc27Q3V036 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc27Q3V036 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc27Q3V036 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc27Q3V036 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc27Q3V036 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Ccdc27Q3V036 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
Ccdc27Q3V036 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc27Q3V036 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc27Q3V036 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc27Q3V036 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc27Q3V036 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc27Q3V036 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc27Q3V036 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc27Q3V036 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc27Q3V036 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc27Q3V036 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc27Q3V036 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc27Q3V036 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc27Q3V036 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc27Q3V036 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc27Q3V036 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc27Q3V036 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc27Q3V036 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc27Q3V036 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc27Q3V036 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc27Q3V036 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc27Q3V036 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc27Q3V036 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc27Q3V036 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc27Q3V036 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc27Q3V036 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc27Q3V036 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc27Q3V036 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc27Q3V036 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc27Q3V036 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc27Q3V036 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc27Q3V036 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc27Q3V036 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc27Q3V036 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc27Q3V036 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms