Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd3l2Q3UXB0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd3l2Q3UXB0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3l2Q3UXB0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd3l2Q3UXB0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd3l2Q3UXB0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3l2Q3UXB0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms