Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWZ0

Trim75, Tripartite motif-containing protein 75, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim75Q3UWZ0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim75Q3UWZ0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim75Q3UWZ0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim75Q3UWZ0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim75Q3UWZ0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim75Q3UWZ0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim75Q3UWZ0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim75Q3UWZ0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Trim75Q3UWZ0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Trim75Q3UWZ0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Trim75Q3UWZ0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim75Q3UWZ0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim75Q3UWZ0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim75Q3UWZ0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim75Q3UWZ0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim75Q3UWZ0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim75Q3UWZ0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim75Q3UWZ0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim75Q3UWZ0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim75Q3UWZ0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim75Q3UWZ0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim75Q3UWZ0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim75Q3UWZ0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim75Q3UWZ0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim75Q3UWZ0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim75Q3UWZ0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim75Q3UWZ0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim75Q3UWZ0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim75Q3UWZ0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Trim75Q3UWZ0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim75Q3UWZ0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim75Q3UWZ0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim75Q3UWZ0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim75Q3UWZ0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim75Q3UWZ0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim75Q3UWZ0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim75Q3UWZ0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim75Q3UWZ0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim75Q3UWZ0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim75Q3UWZ0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim75Q3UWZ0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim75Q3UWZ0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim75Q3UWZ0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim75Q3UWZ0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim75Q3UWZ0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim75Q3UWZ0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim75Q3UWZ0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim75Q3UWZ0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim75Q3UWZ0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim75Q3UWZ0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim75Q3UWZ0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim75Q3UWZ0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim75Q3UWZ0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim75Q3UWZ0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim75Q3UWZ0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim75Q3UWZ0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim75Q3UWZ0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim75Q3UWZ0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim75Q3UWZ0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim75Q3UWZ0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim75Q3UWZ0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim75Q3UWZ0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim75Q3UWZ0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim75Q3UWZ0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim75Q3UWZ0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim75Q3UWZ0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim75Q3UWZ0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim75Q3UWZ0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim75Q3UWZ0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim75Q3UWZ0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim75Q3UWZ0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim75Q3UWZ0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim75Q3UWZ0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim75Q3UWZ0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim75Q3UWZ0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim75Q3UWZ0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim75Q3UWZ0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim75Q3UWZ0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim75Q3UWZ0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim75Q3UWZ0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim75Q3UWZ0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim75Q3UWZ0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim75Q3UWZ0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim75Q3UWZ0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim75Q3UWZ0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim75Q3UWZ0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim75Q3UWZ0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim75Q3UWZ0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim75Q3UWZ0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim75Q3UWZ0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim75Q3UWZ0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim75Q3UWZ0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim75Q3UWZ0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim75Q3UWZ0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim75Q3UWZ0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim75Q3UWZ0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim75Q3UWZ0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim75Q3UWZ0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim75Q3UWZ0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim75Q3UWZ0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms