Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
D13Ertd608eQ3UPR8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
D13Ertd608eQ3UPR8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
D13Ertd608eQ3UPR8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
D13Ertd608eQ3UPR8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
D13Ertd608eQ3UPR8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
D13Ertd608eQ3UPR8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
D13Ertd608eQ3UPR8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
D13Ertd608eQ3UPR8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
D13Ertd608eQ3UPR8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
D13Ertd608eQ3UPR8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
D13Ertd608eQ3UPR8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
D13Ertd608eQ3UPR8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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