Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNW5

Tfcp2l1, Transcription factor CP2-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2l1Q3UNW5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tfcp2l1Q3UNW5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tfcp2l1Q3UNW5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tfcp2l1Q3UNW5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tfcp2l1Q3UNW5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tfcp2l1Q3UNW5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tfcp2l1Q3UNW5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tfcp2l1Q3UNW5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tfcp2l1Q3UNW5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tfcp2l1Q3UNW5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tfcp2l1Q3UNW5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tfcp2l1Q3UNW5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Tfcp2l1Q3UNW5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tfcp2l1Q3UNW5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Tfcp2l1Q3UNW5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tfcp2l1Q3UNW5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tfcp2l1Q3UNW5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tfcp2l1Q3UNW5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tfcp2l1Q3UNW5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tfcp2l1Q3UNW5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tfcp2l1Q3UNW5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tfcp2l1Q3UNW5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tfcp2l1Q3UNW5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tfcp2l1Q3UNW5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tfcp2l1Q3UNW5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tfcp2l1Q3UNW5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tfcp2l1Q3UNW5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tfcp2l1Q3UNW5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tfcp2l1Q3UNW5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tfcp2l1Q3UNW5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tfcp2l1Q3UNW5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Tfcp2l1Q3UNW5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tfcp2l1Q3UNW5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tfcp2l1Q3UNW5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tfcp2l1Q3UNW5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tfcp2l1Q3UNW5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tfcp2l1Q3UNW5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tfcp2l1Q3UNW5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tfcp2l1Q3UNW5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tfcp2l1Q3UNW5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tfcp2l1Q3UNW5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tfcp2l1Q3UNW5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Tfcp2l1Q3UNW5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tfcp2l1Q3UNW5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Tfcp2l1Q3UNW5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tfcp2l1Q3UNW5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tfcp2l1Q3UNW5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Tfcp2l1Q3UNW5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tfcp2l1Q3UNW5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tfcp2l1Q3UNW5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tfcp2l1Q3UNW5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tfcp2l1Q3UNW5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tfcp2l1Q3UNW5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Tfcp2l1Q3UNW5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tfcp2l1Q3UNW5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Tfcp2l1Q3UNW5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Tfcp2l1Q3UNW5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tfcp2l1Q3UNW5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tfcp2l1Q3UNW5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Tfcp2l1Q3UNW5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tfcp2l1Q3UNW5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tfcp2l1Q3UNW5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tfcp2l1Q3UNW5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tfcp2l1Q3UNW5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tfcp2l1Q3UNW5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tfcp2l1Q3UNW5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Tfcp2l1Q3UNW5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tfcp2l1Q3UNW5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tfcp2l1Q3UNW5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Tfcp2l1Q3UNW5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tfcp2l1Q3UNW5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tfcp2l1Q3UNW5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tfcp2l1Q3UNW5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tfcp2l1Q3UNW5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tfcp2l1Q3UNW5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tfcp2l1Q3UNW5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tfcp2l1Q3UNW5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tfcp2l1Q3UNW5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tfcp2l1Q3UNW5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tfcp2l1Q3UNW5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tfcp2l1Q3UNW5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tfcp2l1Q3UNW5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tfcp2l1Q3UNW5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tfcp2l1Q3UNW5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Tfcp2l1Q3UNW5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tfcp2l1Q3UNW5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tfcp2l1Q3UNW5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tfcp2l1Q3UNW5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tfcp2l1Q3UNW5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tfcp2l1Q3UNW5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms