Protein–RNA interactions for Protein: Q3U410

Klhl21, Kelch-like protein 21, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl21Q3U410 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl21Q3U410 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl21Q3U410 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl21Q3U410 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl21Q3U410 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl21Q3U410 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl21Q3U410 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl21Q3U410 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl21Q3U410 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl21Q3U410 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl21Q3U410 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl21Q3U410 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl21Q3U410 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl21Q3U410 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl21Q3U410 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl21Q3U410 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhl21Q3U410 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klhl21Q3U410 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klhl21Q3U410 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl21Q3U410 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhl21Q3U410 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl21Q3U410 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl21Q3U410 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl21Q3U410 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl21Q3U410 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl21Q3U410 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl21Q3U410 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhl21Q3U410 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhl21Q3U410 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhl21Q3U410 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhl21Q3U410 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhl21Q3U410 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhl21Q3U410 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhl21Q3U410 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhl21Q3U410 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhl21Q3U410 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl21Q3U410 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl21Q3U410 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl21Q3U410 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl21Q3U410 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl21Q3U410 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl21Q3U410 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl21Q3U410 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl21Q3U410 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl21Q3U410 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl21Q3U410 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl21Q3U410 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Klhl21Q3U410 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Klhl21Q3U410 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl21Q3U410 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl21Q3U410 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl21Q3U410 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl21Q3U410 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl21Q3U410 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl21Q3U410 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl21Q3U410 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl21Q3U410 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl21Q3U410 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl21Q3U410 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl21Q3U410 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl21Q3U410 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl21Q3U410 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl21Q3U410 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl21Q3U410 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl21Q3U410 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl21Q3U410 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl21Q3U410 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl21Q3U410 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl21Q3U410 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl21Q3U410 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl21Q3U410 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl21Q3U410 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl21Q3U410 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Klhl21Q3U410 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Klhl21Q3U410 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Klhl21Q3U410 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl21Q3U410 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl21Q3U410 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl21Q3U410 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl21Q3U410 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl21Q3U410 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl21Q3U410 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl21Q3U410 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl21Q3U410 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl21Q3U410 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl21Q3U410 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl21Q3U410 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl21Q3U410 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl21Q3U410 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl21Q3U410 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl21Q3U410 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl21Q3U410 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl21Q3U410 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl21Q3U410 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klhl21Q3U410 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl21Q3U410 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl21Q3U410 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl21Q3U410 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl21Q3U410 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Klhl21Q3U410 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms