Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Palb2Q3U0P1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Palb2Q3U0P1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Palb2Q3U0P1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Palb2Q3U0P1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Palb2Q3U0P1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Palb2Q3U0P1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Palb2Q3U0P1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Palb2Q3U0P1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Palb2Q3U0P1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Palb2Q3U0P1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Palb2Q3U0P1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Palb2Q3U0P1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Palb2Q3U0P1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Palb2Q3U0P1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Palb2Q3U0P1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Palb2Q3U0P1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Palb2Q3U0P1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Palb2Q3U0P1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Palb2Q3U0P1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Palb2Q3U0P1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Palb2Q3U0P1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Palb2Q3U0P1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Palb2Q3U0P1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Palb2Q3U0P1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Palb2Q3U0P1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Palb2Q3U0P1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Palb2Q3U0P1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Palb2Q3U0P1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Palb2Q3U0P1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Palb2Q3U0P1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Palb2Q3U0P1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Palb2Q3U0P1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Palb2Q3U0P1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Palb2Q3U0P1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Palb2Q3U0P1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Palb2Q3U0P1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Palb2Q3U0P1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Palb2Q3U0P1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Palb2Q3U0P1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Palb2Q3U0P1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Palb2Q3U0P1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Palb2Q3U0P1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Palb2Q3U0P1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Palb2Q3U0P1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Palb2Q3U0P1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Palb2Q3U0P1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Palb2Q3U0P1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Palb2Q3U0P1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Palb2Q3U0P1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Palb2Q3U0P1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Palb2Q3U0P1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Palb2Q3U0P1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Palb2Q3U0P1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Palb2Q3U0P1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Palb2Q3U0P1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Palb2Q3U0P1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Palb2Q3U0P1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Palb2Q3U0P1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Palb2Q3U0P1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Palb2Q3U0P1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Palb2Q3U0P1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Palb2Q3U0P1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Palb2Q3U0P1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Palb2Q3U0P1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Palb2Q3U0P1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Palb2Q3U0P1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Palb2Q3U0P1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Palb2Q3U0P1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Palb2Q3U0P1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Palb2Q3U0P1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Palb2Q3U0P1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Palb2Q3U0P1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Palb2Q3U0P1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Palb2Q3U0P1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Palb2Q3U0P1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Palb2Q3U0P1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Palb2Q3U0P1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Palb2Q3U0P1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Palb2Q3U0P1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Palb2Q3U0P1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Palb2Q3U0P1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Palb2Q3U0P1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Palb2Q3U0P1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Palb2Q3U0P1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Palb2Q3U0P1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Palb2Q3U0P1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Palb2Q3U0P1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Palb2Q3U0P1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Palb2Q3U0P1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Palb2Q3U0P1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Palb2Q3U0P1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Palb2Q3U0P1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Palb2Q3U0P1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Palb2Q3U0P1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Palb2Q3U0P1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Palb2Q3U0P1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Palb2Q3U0P1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Palb2Q3U0P1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Palb2Q3U0P1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms