Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc102aQ3TMW1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc102aQ3TMW1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc102aQ3TMW1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc102aQ3TMW1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc102aQ3TMW1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc102aQ3TMW1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc102aQ3TMW1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc102aQ3TMW1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc102aQ3TMW1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc102aQ3TMW1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc102aQ3TMW1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc102aQ3TMW1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc102aQ3TMW1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc102aQ3TMW1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc102aQ3TMW1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc102aQ3TMW1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc102aQ3TMW1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc102aQ3TMW1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc102aQ3TMW1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc102aQ3TMW1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc102aQ3TMW1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc102aQ3TMW1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc102aQ3TMW1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc102aQ3TMW1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc102aQ3TMW1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc102aQ3TMW1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc102aQ3TMW1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc102aQ3TMW1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc102aQ3TMW1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc102aQ3TMW1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc102aQ3TMW1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc102aQ3TMW1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc102aQ3TMW1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc102aQ3TMW1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms