Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLS3

Gdpgp1, GDP-D-glucose phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpgp1Q3TLS3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gdpgp1Q3TLS3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gdpgp1Q3TLS3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gdpgp1Q3TLS3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdpgp1Q3TLS3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdpgp1Q3TLS3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdpgp1Q3TLS3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdpgp1Q3TLS3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdpgp1Q3TLS3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdpgp1Q3TLS3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdpgp1Q3TLS3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdpgp1Q3TLS3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdpgp1Q3TLS3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdpgp1Q3TLS3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdpgp1Q3TLS3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdpgp1Q3TLS3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gdpgp1Q3TLS3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gdpgp1Q3TLS3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdpgp1Q3TLS3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gdpgp1Q3TLS3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdpgp1Q3TLS3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdpgp1Q3TLS3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdpgp1Q3TLS3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdpgp1Q3TLS3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdpgp1Q3TLS3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdpgp1Q3TLS3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdpgp1Q3TLS3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdpgp1Q3TLS3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdpgp1Q3TLS3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdpgp1Q3TLS3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdpgp1Q3TLS3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdpgp1Q3TLS3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdpgp1Q3TLS3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdpgp1Q3TLS3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdpgp1Q3TLS3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdpgp1Q3TLS3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdpgp1Q3TLS3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gdpgp1Q3TLS3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gdpgp1Q3TLS3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gdpgp1Q3TLS3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdpgp1Q3TLS3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdpgp1Q3TLS3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gdpgp1Q3TLS3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gdpgp1Q3TLS3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gdpgp1Q3TLS3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gdpgp1Q3TLS3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gdpgp1Q3TLS3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gdpgp1Q3TLS3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gdpgp1Q3TLS3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdpgp1Q3TLS3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdpgp1Q3TLS3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdpgp1Q3TLS3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdpgp1Q3TLS3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdpgp1Q3TLS3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdpgp1Q3TLS3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdpgp1Q3TLS3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gdpgp1Q3TLS3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gdpgp1Q3TLS3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gdpgp1Q3TLS3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gdpgp1Q3TLS3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gdpgp1Q3TLS3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gdpgp1Q3TLS3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gdpgp1Q3TLS3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gdpgp1Q3TLS3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdpgp1Q3TLS3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gdpgp1Q3TLS3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gdpgp1Q3TLS3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gdpgp1Q3TLS3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdpgp1Q3TLS3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdpgp1Q3TLS3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdpgp1Q3TLS3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdpgp1Q3TLS3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdpgp1Q3TLS3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdpgp1Q3TLS3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdpgp1Q3TLS3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdpgp1Q3TLS3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdpgp1Q3TLS3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gdpgp1Q3TLS3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gdpgp1Q3TLS3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gdpgp1Q3TLS3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdpgp1Q3TLS3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdpgp1Q3TLS3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdpgp1Q3TLS3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdpgp1Q3TLS3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdpgp1Q3TLS3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdpgp1Q3TLS3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gdpgp1Q3TLS3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gdpgp1Q3TLS3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gdpgp1Q3TLS3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gdpgp1Q3TLS3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gdpgp1Q3TLS3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gdpgp1Q3TLS3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gdpgp1Q3TLS3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gdpgp1Q3TLS3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gdpgp1Q3TLS3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gdpgp1Q3TLS3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gdpgp1Q3TLS3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gdpgp1Q3TLS3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gdpgp1Q3TLS3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gdpgp1Q3TLS3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms