Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
Smarca4Q3TKT4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
Smarca4Q3TKT4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
Smarca4Q3TKT4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
Smarca4Q3TKT4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
Smarca4Q3TKT4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
Smarca4Q3TKT4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
Smarca4Q3TKT4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
Smarca4Q3TKT4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Smarca4Q3TKT4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
Smarca4Q3TKT4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
Smarca4Q3TKT4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
Smarca4Q3TKT4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC43.47■■■■■ 4.55
Smarca4Q3TKT4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.55
Smarca4Q3TKT4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Smarca4Q3TKT4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Smarca4Q3TKT4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Smarca4Q3TKT4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.43■■■■■ 4.54
Smarca4Q3TKT4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC43.43■■■■■ 4.54
Smarca4Q3TKT4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
Smarca4Q3TKT4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
Smarca4Q3TKT4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
Smarca4Q3TKT4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC43.38■■■■■ 4.54
Smarca4Q3TKT4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC43.37■■■■■ 4.53
Smarca4Q3TKT4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC43.37■■■■■ 4.53
Smarca4Q3TKT4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
Smarca4Q3TKT4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC43.36■■■■■ 4.53
Smarca4Q3TKT4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
Smarca4Q3TKT4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
Smarca4Q3TKT4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
Smarca4Q3TKT4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC43.34■■■■■ 4.53
Smarca4Q3TKT4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Smarca4Q3TKT4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Smarca4Q3TKT4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
Smarca4Q3TKT4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
Smarca4Q3TKT4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
Smarca4Q3TKT4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC43.32■■■■■ 4.53
Smarca4Q3TKT4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.53
Smarca4Q3TKT4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
Smarca4Q3TKT4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
Smarca4Q3TKT4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
Smarca4Q3TKT4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
Smarca4Q3TKT4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC43.3■■■■■ 4.52
Smarca4Q3TKT4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC43.3■■■■■ 4.52
Smarca4Q3TKT4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
Smarca4Q3TKT4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
Smarca4Q3TKT4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
Smarca4Q3TKT4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
Smarca4Q3TKT4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.24■■■■■ 4.51
Smarca4Q3TKT4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
Smarca4Q3TKT4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Smarca4Q3TKT4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Smarca4Q3TKT4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC43.21■■■■■ 4.51
Smarca4Q3TKT4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
Smarca4Q3TKT4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.2■■■■■ 4.51
Smarca4Q3TKT4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.51
Smarca4Q3TKT4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC43.19■■■■■ 4.51
Smarca4Q3TKT4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Smarca4Q3TKT4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC43.15■■■■■ 4.5
Smarca4Q3TKT4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
Smarca4Q3TKT4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
Smarca4Q3TKT4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
Smarca4Q3TKT4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
Smarca4Q3TKT4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
Smarca4Q3TKT4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
Smarca4Q3TKT4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC43.09■■■■■ 4.49
Smarca4Q3TKT4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
Smarca4Q3TKT4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC43.07■■■■■ 4.48
Smarca4Q3TKT4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC43.07■■■■■ 4.48
Smarca4Q3TKT4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
Smarca4Q3TKT4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
Smarca4Q3TKT4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
Smarca4Q3TKT4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
Smarca4Q3TKT4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Smarca4Q3TKT4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Smarca4Q3TKT4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
Smarca4Q3TKT4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC43■■■■■ 4.47
Smarca4Q3TKT4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
Smarca4Q3TKT4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
Smarca4Q3TKT4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
Smarca4Q3TKT4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
Smarca4Q3TKT4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.97■■■■■ 4.47
Smarca4Q3TKT4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
Smarca4Q3TKT4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
Smarca4Q3TKT4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
Smarca4Q3TKT4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
Smarca4Q3TKT4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC42.93■■■■■ 4.46
Smarca4Q3TKT4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC42.93■■■■■ 4.46
Smarca4Q3TKT4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC42.93■■■■■ 4.46
Smarca4Q3TKT4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
Smarca4Q3TKT4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
Smarca4Q3TKT4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC42.91■■■■■ 4.46
Smarca4Q3TKT4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
Smarca4Q3TKT4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
Smarca4Q3TKT4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
Smarca4Q3TKT4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC42.86■■■■■ 4.45
Smarca4Q3TKT4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC42.84■■■■■ 4.45
Smarca4Q3TKT4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC42.84■■■■■ 4.45
Smarca4Q3TKT4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
Smarca4Q3TKT4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.6 ms