Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDX8

Cyb5r4, Cytochrome b5 reductase 4, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb5r4Q3TDX8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyb5r4Q3TDX8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyb5r4Q3TDX8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyb5r4Q3TDX8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyb5r4Q3TDX8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyb5r4Q3TDX8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyb5r4Q3TDX8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cyb5r4Q3TDX8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyb5r4Q3TDX8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyb5r4Q3TDX8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyb5r4Q3TDX8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyb5r4Q3TDX8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyb5r4Q3TDX8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyb5r4Q3TDX8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyb5r4Q3TDX8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cyb5r4Q3TDX8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cyb5r4Q3TDX8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cyb5r4Q3TDX8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyb5r4Q3TDX8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyb5r4Q3TDX8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyb5r4Q3TDX8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyb5r4Q3TDX8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyb5r4Q3TDX8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyb5r4Q3TDX8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyb5r4Q3TDX8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyb5r4Q3TDX8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyb5r4Q3TDX8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyb5r4Q3TDX8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyb5r4Q3TDX8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyb5r4Q3TDX8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cyb5r4Q3TDX8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cyb5r4Q3TDX8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cyb5r4Q3TDX8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cyb5r4Q3TDX8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cyb5r4Q3TDX8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cyb5r4Q3TDX8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyb5r4Q3TDX8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyb5r4Q3TDX8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyb5r4Q3TDX8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyb5r4Q3TDX8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyb5r4Q3TDX8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyb5r4Q3TDX8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyb5r4Q3TDX8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyb5r4Q3TDX8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyb5r4Q3TDX8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyb5r4Q3TDX8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyb5r4Q3TDX8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyb5r4Q3TDX8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyb5r4Q3TDX8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyb5r4Q3TDX8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyb5r4Q3TDX8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyb5r4Q3TDX8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyb5r4Q3TDX8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyb5r4Q3TDX8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyb5r4Q3TDX8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyb5r4Q3TDX8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyb5r4Q3TDX8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyb5r4Q3TDX8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyb5r4Q3TDX8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyb5r4Q3TDX8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyb5r4Q3TDX8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyb5r4Q3TDX8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyb5r4Q3TDX8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyb5r4Q3TDX8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyb5r4Q3TDX8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyb5r4Q3TDX8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyb5r4Q3TDX8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyb5r4Q3TDX8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyb5r4Q3TDX8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cyb5r4Q3TDX8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyb5r4Q3TDX8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyb5r4Q3TDX8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyb5r4Q3TDX8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyb5r4Q3TDX8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyb5r4Q3TDX8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyb5r4Q3TDX8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyb5r4Q3TDX8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyb5r4Q3TDX8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyb5r4Q3TDX8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyb5r4Q3TDX8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyb5r4Q3TDX8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyb5r4Q3TDX8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyb5r4Q3TDX8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyb5r4Q3TDX8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyb5r4Q3TDX8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyb5r4Q3TDX8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyb5r4Q3TDX8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyb5r4Q3TDX8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyb5r4Q3TDX8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyb5r4Q3TDX8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyb5r4Q3TDX8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyb5r4Q3TDX8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyb5r4Q3TDX8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyb5r4Q3TDX8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyb5r4Q3TDX8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyb5r4Q3TDX8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyb5r4Q3TDX8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyb5r4Q3TDX8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyb5r4Q3TDX8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyb5r4Q3TDX8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms