Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Samd11Q1RNF8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Samd11Q1RNF8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Samd11Q1RNF8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Samd11Q1RNF8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Samd11Q1RNF8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Samd11Q1RNF8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Samd11Q1RNF8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Samd11Q1RNF8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Samd11Q1RNF8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Samd11Q1RNF8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Samd11Q1RNF8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Samd11Q1RNF8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Samd11Q1RNF8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Samd11Q1RNF8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Samd11Q1RNF8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Samd11Q1RNF8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Samd11Q1RNF8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Samd11Q1RNF8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Samd11Q1RNF8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Samd11Q1RNF8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Samd11Q1RNF8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Samd11Q1RNF8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Samd11Q1RNF8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Samd11Q1RNF8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Samd11Q1RNF8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Samd11Q1RNF8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Samd11Q1RNF8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Samd11Q1RNF8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Samd11Q1RNF8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Samd11Q1RNF8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Samd11Q1RNF8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Samd11Q1RNF8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Samd11Q1RNF8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Samd11Q1RNF8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Samd11Q1RNF8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Samd11Q1RNF8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Samd11Q1RNF8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Samd11Q1RNF8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Samd11Q1RNF8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Samd11Q1RNF8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Samd11Q1RNF8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Samd11Q1RNF8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Samd11Q1RNF8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Samd11Q1RNF8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Samd11Q1RNF8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Samd11Q1RNF8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Samd11Q1RNF8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Samd11Q1RNF8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Samd11Q1RNF8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Samd11Q1RNF8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Samd11Q1RNF8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Samd11Q1RNF8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Samd11Q1RNF8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Samd11Q1RNF8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Samd11Q1RNF8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Samd11Q1RNF8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Samd11Q1RNF8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Samd11Q1RNF8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Samd11Q1RNF8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Samd11Q1RNF8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Samd11Q1RNF8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Samd11Q1RNF8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Samd11Q1RNF8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Samd11Q1RNF8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Samd11Q1RNF8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Samd11Q1RNF8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Samd11Q1RNF8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Samd11Q1RNF8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Samd11Q1RNF8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Samd11Q1RNF8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Samd11Q1RNF8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Samd11Q1RNF8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Samd11Q1RNF8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Samd11Q1RNF8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Samd11Q1RNF8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Samd11Q1RNF8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Samd11Q1RNF8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Samd11Q1RNF8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Samd11Q1RNF8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Samd11Q1RNF8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Samd11Q1RNF8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Samd11Q1RNF8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Samd11Q1RNF8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Samd11Q1RNF8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Samd11Q1RNF8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Samd11Q1RNF8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Samd11Q1RNF8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Samd11Q1RNF8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Samd11Q1RNF8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Samd11Q1RNF8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Samd11Q1RNF8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Samd11Q1RNF8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Samd11Q1RNF8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Samd11Q1RNF8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Samd11Q1RNF8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Samd11Q1RNF8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Samd11Q1RNF8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Samd11Q1RNF8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Samd11Q1RNF8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms