Protein–RNA interactions for Protein: Q14A28

Prok1, Prokineticin-1, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prok1Q14A28 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20,05■□□□□ 0,8
Prok1Q14A28 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Prok1Q14A28 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Prok1Q14A28 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20,05■□□□□ 0,8
Prok1Q14A28 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Prok1Q14A28 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20,05■□□□□ 0,8
Prok1Q14A28 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20,05■□□□□ 0,8
Prok1Q14A28 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Prok1Q14A28 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
Prok1Q14A28 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
Prok1Q14A28 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,03■□□□□ 0,8
Prok1Q14A28 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,8
Prok1Q14A28 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,8
Prok1Q14A28 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,8
Prok1Q14A28 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,8
Prok1Q14A28 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,8
Prok1Q14A28 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20,02■□□□□ 0,8
Prok1Q14A28 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,02■□□□□ 0,8
Prok1Q14A28 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Prok1Q14A28 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Prok1Q14A28 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,01■□□□□ 0,79
Prok1Q14A28 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Prok1Q14A28 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Prok1Q14A28 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Prok1Q14A28 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Prok1Q14A28 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,98■□□□□ 0,79
Prok1Q14A28 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19,98■□□□□ 0,79
Prok1Q14A28 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Prok1Q14A28 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Prok1Q14A28 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,97■□□□□ 0,79
Prok1Q14A28 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Prok1Q14A28 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Prok1Q14A28 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Prok1Q14A28 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Prok1Q14A28 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Prok1Q14A28 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Prok1Q14A28 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Prok1Q14A28 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19,95■□□□□ 0,78
Prok1Q14A28 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Prok1Q14A28 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Prok1Q14A28 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Prok1Q14A28 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Prok1Q14A28 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
Prok1Q14A28 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
Prok1Q14A28 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19,93■□□□□ 0,78
Prok1Q14A28 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Prok1Q14A28 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Prok1Q14A28 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Prok1Q14A28 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Prok1Q14A28 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19,91■□□□□ 0,78
Prok1Q14A28 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
Prok1Q14A28 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19,91■□□□□ 0,78
Prok1Q14A28 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
Prok1Q14A28 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19,9■□□□□ 0,78
Prok1Q14A28 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Prok1Q14A28 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Prok1Q14A28 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
Prok1Q14A28 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
Prok1Q14A28 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19,88■□□□□ 0,77
Prok1Q14A28 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19,88■□□□□ 0,77
Prok1Q14A28 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19,88■□□□□ 0,77
Prok1Q14A28 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19,88■□□□□ 0,77
Prok1Q14A28 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Prok1Q14A28 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19,88■□□□□ 0,77
Prok1Q14A28 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19,88■□□□□ 0,77
Prok1Q14A28 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Prok1Q14A28 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Prok1Q14A28 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19,87■□□□□ 0,77
Prok1Q14A28 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Prok1Q14A28 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19,87■□□□□ 0,77
Prok1Q14A28 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Prok1Q14A28 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Prok1Q14A28 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Prok1Q14A28 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Prok1Q14A28 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,86■□□□□ 0,77
Prok1Q14A28 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19,86■□□□□ 0,77
Prok1Q14A28 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Prok1Q14A28 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Prok1Q14A28 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Prok1Q14A28 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Prok1Q14A28 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19,86■□□□□ 0,77
Prok1Q14A28 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19,86■□□□□ 0,77
Prok1Q14A28 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Prok1Q14A28 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19,85■□□□□ 0,77
Prok1Q14A28 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
Prok1Q14A28 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,77
Prok1Q14A28 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
Prok1Q14A28 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19,82■□□□□ 0,76
Prok1Q14A28 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19,82■□□□□ 0,76
Prok1Q14A28 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
Prok1Q14A28 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
Prok1Q14A28 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
Prok1Q14A28 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19,8■□□□□ 0,76
Prok1Q14A28 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,8■□□□□ 0,76
Prok1Q14A28 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Prok1Q14A28 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,79■□□□□ 0,76
Prok1Q14A28 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,79■□□□□ 0,76
Prok1Q14A28 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19,79■□□□□ 0,76
Prok1Q14A28 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19,79■□□□□ 0,76
Prok1Q14A28 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,78■□□□□ 0,76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45,1 ms