Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc162pQ0VG85 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc162pQ0VG85 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc162pQ0VG85 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc162pQ0VG85 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc162pQ0VG85 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc162pQ0VG85 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc162pQ0VG85 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc162pQ0VG85 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ccdc162pQ0VG85 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc162pQ0VG85 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc162pQ0VG85 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc162pQ0VG85 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc162pQ0VG85 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc162pQ0VG85 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc162pQ0VG85 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc162pQ0VG85 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc162pQ0VG85 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc162pQ0VG85 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc162pQ0VG85 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc162pQ0VG85 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc162pQ0VG85 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc162pQ0VG85 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc162pQ0VG85 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc162pQ0VG85 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc162pQ0VG85 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ccdc162pQ0VG85 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc162pQ0VG85 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc162pQ0VG85 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc162pQ0VG85 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc162pQ0VG85 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc162pQ0VG85 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc162pQ0VG85 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc162pQ0VG85 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc162pQ0VG85 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc162pQ0VG85 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc162pQ0VG85 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc162pQ0VG85 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc162pQ0VG85 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc162pQ0VG85 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc162pQ0VG85 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc162pQ0VG85 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc162pQ0VG85 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc162pQ0VG85 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc162pQ0VG85 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc162pQ0VG85 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc162pQ0VG85 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc162pQ0VG85 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc162pQ0VG85 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc162pQ0VG85 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc162pQ0VG85 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc162pQ0VG85 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc162pQ0VG85 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc162pQ0VG85 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc162pQ0VG85 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc162pQ0VG85 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc162pQ0VG85 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc162pQ0VG85 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc162pQ0VG85 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc162pQ0VG85 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc162pQ0VG85 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc162pQ0VG85 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc162pQ0VG85 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc162pQ0VG85 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc162pQ0VG85 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc162pQ0VG85 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc162pQ0VG85 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc162pQ0VG85 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc162pQ0VG85 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc162pQ0VG85 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc162pQ0VG85 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc162pQ0VG85 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc162pQ0VG85 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc162pQ0VG85 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc162pQ0VG85 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc162pQ0VG85 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc162pQ0VG85 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc162pQ0VG85 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc162pQ0VG85 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc162pQ0VG85 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc162pQ0VG85 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc162pQ0VG85 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc162pQ0VG85 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc162pQ0VG85 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc162pQ0VG85 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc162pQ0VG85 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc162pQ0VG85 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc162pQ0VG85 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc162pQ0VG85 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc162pQ0VG85 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc162pQ0VG85 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc162pQ0VG85 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc162pQ0VG85 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc162pQ0VG85 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc162pQ0VG85 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms