Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb8Q0VBD0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb8Q0VBD0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb8Q0VBD0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb8Q0VBD0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb8Q0VBD0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb8Q0VBD0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb8Q0VBD0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb8Q0VBD0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb8Q0VBD0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb8Q0VBD0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb8Q0VBD0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb8Q0VBD0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb8Q0VBD0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb8Q0VBD0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb8Q0VBD0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb8Q0VBD0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb8Q0VBD0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itgb8Q0VBD0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itgb8Q0VBD0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itgb8Q0VBD0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb8Q0VBD0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb8Q0VBD0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb8Q0VBD0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb8Q0VBD0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb8Q0VBD0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb8Q0VBD0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb8Q0VBD0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb8Q0VBD0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb8Q0VBD0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb8Q0VBD0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb8Q0VBD0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb8Q0VBD0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb8Q0VBD0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb8Q0VBD0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb8Q0VBD0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb8Q0VBD0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb8Q0VBD0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Itgb8Q0VBD0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Itgb8Q0VBD0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb8Q0VBD0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb8Q0VBD0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb8Q0VBD0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb8Q0VBD0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb8Q0VBD0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb8Q0VBD0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb8Q0VBD0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb8Q0VBD0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb8Q0VBD0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb8Q0VBD0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb8Q0VBD0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb8Q0VBD0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb8Q0VBD0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb8Q0VBD0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb8Q0VBD0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb8Q0VBD0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb8Q0VBD0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb8Q0VBD0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb8Q0VBD0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb8Q0VBD0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb8Q0VBD0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb8Q0VBD0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb8Q0VBD0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb8Q0VBD0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb8Q0VBD0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb8Q0VBD0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb8Q0VBD0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb8Q0VBD0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb8Q0VBD0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb8Q0VBD0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb8Q0VBD0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb8Q0VBD0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb8Q0VBD0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb8Q0VBD0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb8Q0VBD0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb8Q0VBD0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb8Q0VBD0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itgb8Q0VBD0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb8Q0VBD0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb8Q0VBD0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb8Q0VBD0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb8Q0VBD0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb8Q0VBD0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb8Q0VBD0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb8Q0VBD0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb8Q0VBD0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb8Q0VBD0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb8Q0VBD0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb8Q0VBD0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb8Q0VBD0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb8Q0VBD0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb8Q0VBD0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb8Q0VBD0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb8Q0VBD0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb8Q0VBD0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb8Q0VBD0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb8Q0VBD0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb8Q0VBD0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb8Q0VBD0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms