Protein–RNA interactions for Protein: Q08EG8

Krtap10-4, Keratin-associated protein 10-4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap10-4Q08EG8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krtap10-4Q08EG8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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Krtap10-4Q08EG8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krtap10-4Q08EG8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Krtap10-4Q08EG8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krtap10-4Q08EG8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Krtap10-4Q08EG8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Krtap10-4Q08EG8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Krtap10-4Q08EG8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Krtap10-4Q08EG8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krtap10-4Q08EG8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krtap10-4Q08EG8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krtap10-4Q08EG8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krtap10-4Q08EG8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Krtap10-4Q08EG8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krtap10-4Q08EG8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krtap10-4Q08EG8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krtap10-4Q08EG8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krtap10-4Q08EG8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Krtap10-4Q08EG8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krtap10-4Q08EG8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krtap10-4Q08EG8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krtap10-4Q08EG8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krtap10-4Q08EG8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krtap10-4Q08EG8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krtap10-4Q08EG8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krtap10-4Q08EG8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krtap10-4Q08EG8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krtap10-4Q08EG8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krtap10-4Q08EG8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krtap10-4Q08EG8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krtap10-4Q08EG8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krtap10-4Q08EG8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Krtap10-4Q08EG8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms