Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sox13Q04891 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sox13Q04891 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sox13Q04891 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox13Q04891 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox13Q04891 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox13Q04891 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox13Q04891 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox13Q04891 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sox13Q04891 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sox13Q04891 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sox13Q04891 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sox13Q04891 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sox13Q04891 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sox13Q04891 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sox13Q04891 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sox13Q04891 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sox13Q04891 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sox13Q04891 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sox13Q04891 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sox13Q04891 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Sox13Q04891 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sox13Q04891 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sox13Q04891 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Sox13Q04891 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sox13Q04891 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sox13Q04891 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sox13Q04891 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sox13Q04891 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sox13Q04891 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sox13Q04891 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox13Q04891 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox13Q04891 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox13Q04891 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox13Q04891 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sox13Q04891 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sox13Q04891 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sox13Q04891 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sox13Q04891 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sox13Q04891 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sox13Q04891 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox13Q04891 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox13Q04891 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox13Q04891 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox13Q04891 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox13Q04891 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox13Q04891 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sox13Q04891 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sox13Q04891 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sox13Q04891 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sox13Q04891 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sox13Q04891 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sox13Q04891 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sox13Q04891 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sox13Q04891 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox13Q04891 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox13Q04891 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox13Q04891 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox13Q04891 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox13Q04891 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox13Q04891 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sox13Q04891 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sox13Q04891 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sox13Q04891 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sox13Q04891 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sox13Q04891 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sox13Q04891 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox13Q04891 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox13Q04891 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox13Q04891 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sox13Q04891 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sox13Q04891 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sox13Q04891 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sox13Q04891 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sox13Q04891 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sox13Q04891 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sox13Q04891 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sox13Q04891 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sox13Q04891 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sox13Q04891 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sox13Q04891 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sox13Q04891 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sox13Q04891 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sox13Q04891 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox13Q04891 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox13Q04891 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox13Q04891 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox13Q04891 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox13Q04891 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox13Q04891 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox13Q04891 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sox13Q04891 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sox13Q04891 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox13Q04891 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox13Q04891 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox13Q04891 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox13Q04891 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox13Q04891 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox13Q04891 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sox13Q04891 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms