Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smpd1Q04519 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smpd1Q04519 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smpd1Q04519 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smpd1Q04519 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smpd1Q04519 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smpd1Q04519 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smpd1Q04519 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smpd1Q04519 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Smpd1Q04519 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smpd1Q04519 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smpd1Q04519 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smpd1Q04519 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Smpd1Q04519 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smpd1Q04519 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smpd1Q04519 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smpd1Q04519 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smpd1Q04519 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smpd1Q04519 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smpd1Q04519 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smpd1Q04519 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smpd1Q04519 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smpd1Q04519 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smpd1Q04519 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smpd1Q04519 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smpd1Q04519 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Smpd1Q04519 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smpd1Q04519 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smpd1Q04519 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smpd1Q04519 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smpd1Q04519 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smpd1Q04519 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smpd1Q04519 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smpd1Q04519 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smpd1Q04519 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smpd1Q04519 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smpd1Q04519 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Smpd1Q04519 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smpd1Q04519 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smpd1Q04519 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smpd1Q04519 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Smpd1Q04519 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smpd1Q04519 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smpd1Q04519 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smpd1Q04519 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smpd1Q04519 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smpd1Q04519 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smpd1Q04519 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smpd1Q04519 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smpd1Q04519 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smpd1Q04519 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smpd1Q04519 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Smpd1Q04519 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smpd1Q04519 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smpd1Q04519 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smpd1Q04519 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smpd1Q04519 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smpd1Q04519 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smpd1Q04519 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smpd1Q04519 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smpd1Q04519 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smpd1Q04519 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Smpd1Q04519 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smpd1Q04519 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smpd1Q04519 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smpd1Q04519 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smpd1Q04519 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smpd1Q04519 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smpd1Q04519 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smpd1Q04519 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Smpd1Q04519 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smpd1Q04519 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smpd1Q04519 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smpd1Q04519 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smpd1Q04519 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smpd1Q04519 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smpd1Q04519 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smpd1Q04519 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Smpd1Q04519 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smpd1Q04519 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smpd1Q04519 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Smpd1Q04519 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smpd1Q04519 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smpd1Q04519 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smpd1Q04519 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smpd1Q04519 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smpd1Q04519 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smpd1Q04519 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smpd1Q04519 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Smpd1Q04519 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smpd1Q04519 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smpd1Q04519 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smpd1Q04519 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smpd1Q04519 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smpd1Q04519 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smpd1Q04519 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smpd1Q04519 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smpd1Q04519 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smpd1Q04519 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smpd1Q04519 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms