Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VcpQ01853 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VcpQ01853 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VcpQ01853 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VcpQ01853 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VcpQ01853 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VcpQ01853 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VcpQ01853 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VcpQ01853 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VcpQ01853 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VcpQ01853 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VcpQ01853 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VcpQ01853 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VcpQ01853 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VcpQ01853 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VcpQ01853 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VcpQ01853 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VcpQ01853 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VcpQ01853 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VcpQ01853 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VcpQ01853 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VcpQ01853 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VcpQ01853 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VcpQ01853 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VcpQ01853 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VcpQ01853 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VcpQ01853 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VcpQ01853 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VcpQ01853 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VcpQ01853 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VcpQ01853 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VcpQ01853 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VcpQ01853 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VcpQ01853 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VcpQ01853 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VcpQ01853 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VcpQ01853 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VcpQ01853 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VcpQ01853 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VcpQ01853 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VcpQ01853 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VcpQ01853 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VcpQ01853 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VcpQ01853 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VcpQ01853 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VcpQ01853 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VcpQ01853 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VcpQ01853 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VcpQ01853 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VcpQ01853 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VcpQ01853 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VcpQ01853 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VcpQ01853 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VcpQ01853 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VcpQ01853 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VcpQ01853 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VcpQ01853 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VcpQ01853 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VcpQ01853 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VcpQ01853 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VcpQ01853 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VcpQ01853 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VcpQ01853 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VcpQ01853 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VcpQ01853 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VcpQ01853 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VcpQ01853 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VcpQ01853 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VcpQ01853 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VcpQ01853 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VcpQ01853 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VcpQ01853 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VcpQ01853 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VcpQ01853 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VcpQ01853 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VcpQ01853 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VcpQ01853 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VcpQ01853 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VcpQ01853 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VcpQ01853 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VcpQ01853 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VcpQ01853 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VcpQ01853 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VcpQ01853 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VcpQ01853 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VcpQ01853 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VcpQ01853 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VcpQ01853 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VcpQ01853 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VcpQ01853 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VcpQ01853 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VcpQ01853 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VcpQ01853 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VcpQ01853 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VcpQ01853 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VcpQ01853 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VcpQ01853 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VcpQ01853 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VcpQ01853 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VcpQ01853 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.7 ms