Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HmgcrQ01237 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HmgcrQ01237 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HmgcrQ01237 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HmgcrQ01237 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HmgcrQ01237 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HmgcrQ01237 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HmgcrQ01237 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HmgcrQ01237 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HmgcrQ01237 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HmgcrQ01237 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HmgcrQ01237 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HmgcrQ01237 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HmgcrQ01237 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HmgcrQ01237 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HmgcrQ01237 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HmgcrQ01237 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HmgcrQ01237 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HmgcrQ01237 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HmgcrQ01237 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HmgcrQ01237 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HmgcrQ01237 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HmgcrQ01237 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HmgcrQ01237 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HmgcrQ01237 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HmgcrQ01237 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HmgcrQ01237 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HmgcrQ01237 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HmgcrQ01237 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HmgcrQ01237 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HmgcrQ01237 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HmgcrQ01237 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HmgcrQ01237 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HmgcrQ01237 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HmgcrQ01237 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HmgcrQ01237 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HmgcrQ01237 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HmgcrQ01237 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HmgcrQ01237 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HmgcrQ01237 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HmgcrQ01237 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HmgcrQ01237 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HmgcrQ01237 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HmgcrQ01237 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HmgcrQ01237 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HmgcrQ01237 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HmgcrQ01237 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HmgcrQ01237 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HmgcrQ01237 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HmgcrQ01237 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HmgcrQ01237 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HmgcrQ01237 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HmgcrQ01237 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HmgcrQ01237 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HmgcrQ01237 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HmgcrQ01237 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HmgcrQ01237 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HmgcrQ01237 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HmgcrQ01237 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HmgcrQ01237 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HmgcrQ01237 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HmgcrQ01237 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HmgcrQ01237 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HmgcrQ01237 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HmgcrQ01237 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HmgcrQ01237 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HmgcrQ01237 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HmgcrQ01237 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HmgcrQ01237 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HmgcrQ01237 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HmgcrQ01237 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HmgcrQ01237 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HmgcrQ01237 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HmgcrQ01237 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HmgcrQ01237 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HmgcrQ01237 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HmgcrQ01237 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HmgcrQ01237 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HmgcrQ01237 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HmgcrQ01237 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HmgcrQ01237 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HmgcrQ01237 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HmgcrQ01237 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HmgcrQ01237 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HmgcrQ01237 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HmgcrQ01237 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HmgcrQ01237 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HmgcrQ01237 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HmgcrQ01237 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HmgcrQ01237 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HmgcrQ01237 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HmgcrQ01237 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HmgcrQ01237 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HmgcrQ01237 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HmgcrQ01237 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HmgcrQ01237 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HmgcrQ01237 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HmgcrQ01237 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HmgcrQ01237 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HmgcrQ01237 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms