Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cry1P97784 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cry1P97784 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cry1P97784 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cry1P97784 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cry1P97784 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cry1P97784 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cry1P97784 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cry1P97784 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cry1P97784 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cry1P97784 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cry1P97784 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cry1P97784 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cry1P97784 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cry1P97784 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cry1P97784 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cry1P97784 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cry1P97784 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cry1P97784 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cry1P97784 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cry1P97784 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cry1P97784 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cry1P97784 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cry1P97784 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cry1P97784 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cry1P97784 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cry1P97784 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cry1P97784 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cry1P97784 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cry1P97784 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cry1P97784 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cry1P97784 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cry1P97784 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cry1P97784 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cry1P97784 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cry1P97784 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cry1P97784 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cry1P97784 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cry1P97784 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cry1P97784 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cry1P97784 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cry1P97784 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cry1P97784 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cry1P97784 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cry1P97784 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cry1P97784 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cry1P97784 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cry1P97784 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Cry1P97784 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cry1P97784 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cry1P97784 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cry1P97784 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cry1P97784 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cry1P97784 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cry1P97784 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cry1P97784 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cry1P97784 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cry1P97784 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cry1P97784 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cry1P97784 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cry1P97784 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cry1P97784 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cry1P97784 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cry1P97784 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cry1P97784 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cry1P97784 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cry1P97784 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cry1P97784 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cry1P97784 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cry1P97784 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cry1P97784 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cry1P97784 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cry1P97784 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cry1P97784 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cry1P97784 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cry1P97784 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cry1P97784 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cry1P97784 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cry1P97784 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cry1P97784 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cry1P97784 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cry1P97784 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cry1P97784 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cry1P97784 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cry1P97784 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cry1P97784 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cry1P97784 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cry1P97784 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cry1P97784 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cry1P97784 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cry1P97784 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cry1P97784 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cry1P97784 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cry1P97784 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cry1P97784 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cry1P97784 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cry1P97784 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cry1P97784 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cry1P97784 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cry1P97784 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms