Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nbr1P97432 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nbr1P97432 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nbr1P97432 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nbr1P97432 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nbr1P97432 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nbr1P97432 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nbr1P97432 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nbr1P97432 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nbr1P97432 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nbr1P97432 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nbr1P97432 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nbr1P97432 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nbr1P97432 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Nbr1P97432 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nbr1P97432 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nbr1P97432 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nbr1P97432 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nbr1P97432 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nbr1P97432 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nbr1P97432 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nbr1P97432 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nbr1P97432 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nbr1P97432 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nbr1P97432 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nbr1P97432 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nbr1P97432 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nbr1P97432 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nbr1P97432 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nbr1P97432 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nbr1P97432 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nbr1P97432 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nbr1P97432 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nbr1P97432 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nbr1P97432 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nbr1P97432 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nbr1P97432 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nbr1P97432 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nbr1P97432 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Nbr1P97432 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nbr1P97432 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nbr1P97432 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nbr1P97432 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nbr1P97432 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nbr1P97432 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nbr1P97432 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nbr1P97432 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nbr1P97432 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nbr1P97432 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nbr1P97432 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nbr1P97432 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nbr1P97432 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nbr1P97432 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nbr1P97432 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nbr1P97432 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nbr1P97432 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nbr1P97432 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nbr1P97432 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nbr1P97432 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nbr1P97432 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nbr1P97432 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nbr1P97432 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nbr1P97432 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nbr1P97432 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nbr1P97432 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nbr1P97432 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nbr1P97432 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nbr1P97432 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nbr1P97432 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nbr1P97432 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nbr1P97432 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nbr1P97432 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nbr1P97432 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nbr1P97432 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nbr1P97432 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nbr1P97432 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nbr1P97432 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nbr1P97432 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nbr1P97432 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nbr1P97432 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nbr1P97432 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nbr1P97432 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nbr1P97432 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nbr1P97432 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nbr1P97432 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nbr1P97432 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nbr1P97432 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nbr1P97432 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nbr1P97432 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nbr1P97432 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nbr1P97432 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Nbr1P97432 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nbr1P97432 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nbr1P97432 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nbr1P97432 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nbr1P97432 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nbr1P97432 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nbr1P97432 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nbr1P97432 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nbr1P97432 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms