Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SmsP97355 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SmsP97355 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SmsP97355 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SmsP97355 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SmsP97355 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SmsP97355 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SmsP97355 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SmsP97355 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SmsP97355 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SmsP97355 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SmsP97355 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SmsP97355 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SmsP97355 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SmsP97355 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SmsP97355 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SmsP97355 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SmsP97355 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SmsP97355 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SmsP97355 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SmsP97355 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SmsP97355 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SmsP97355 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SmsP97355 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SmsP97355 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SmsP97355 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SmsP97355 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SmsP97355 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SmsP97355 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SmsP97355 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SmsP97355 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SmsP97355 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SmsP97355 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SmsP97355 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SmsP97355 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SmsP97355 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SmsP97355 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SmsP97355 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SmsP97355 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SmsP97355 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SmsP97355 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SmsP97355 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SmsP97355 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SmsP97355 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SmsP97355 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SmsP97355 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SmsP97355 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SmsP97355 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SmsP97355 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SmsP97355 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SmsP97355 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SmsP97355 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SmsP97355 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SmsP97355 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SmsP97355 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SmsP97355 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SmsP97355 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SmsP97355 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SmsP97355 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SmsP97355 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SmsP97355 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SmsP97355 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SmsP97355 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SmsP97355 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SmsP97355 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SmsP97355 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SmsP97355 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SmsP97355 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SmsP97355 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SmsP97355 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SmsP97355 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SmsP97355 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SmsP97355 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SmsP97355 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SmsP97355 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SmsP97355 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SmsP97355 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SmsP97355 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SmsP97355 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SmsP97355 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SmsP97355 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SmsP97355 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SmsP97355 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SmsP97355 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SmsP97355 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SmsP97355 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SmsP97355 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SmsP97355 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SmsP97355 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SmsP97355 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SmsP97355 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SmsP97355 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SmsP97355 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SmsP97355 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SmsP97355 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SmsP97355 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SmsP97355 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SmsP97355 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SmsP97355 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SmsP97355 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms