Protein–RNA interactions for Protein: P97298

Serpinf1, Pigment epithelium-derived factor, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinf1P97298 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Serpinf1P97298 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Serpinf1P97298 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Serpinf1P97298 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Serpinf1P97298 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Serpinf1P97298 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Serpinf1P97298 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Serpinf1P97298 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Serpinf1P97298 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Serpinf1P97298 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpinf1P97298 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpinf1P97298 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpinf1P97298 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpinf1P97298 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpinf1P97298 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpinf1P97298 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpinf1P97298 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpinf1P97298 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpinf1P97298 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpinf1P97298 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpinf1P97298 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpinf1P97298 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpinf1P97298 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpinf1P97298 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpinf1P97298 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpinf1P97298 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpinf1P97298 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpinf1P97298 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpinf1P97298 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpinf1P97298 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpinf1P97298 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpinf1P97298 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpinf1P97298 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpinf1P97298 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpinf1P97298 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpinf1P97298 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpinf1P97298 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Serpinf1P97298 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Serpinf1P97298 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Serpinf1P97298 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Serpinf1P97298 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Serpinf1P97298 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Serpinf1P97298 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Serpinf1P97298 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Serpinf1P97298 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Serpinf1P97298 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Serpinf1P97298 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Serpinf1P97298 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Serpinf1P97298 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Serpinf1P97298 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Serpinf1P97298 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Serpinf1P97298 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Serpinf1P97298 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Serpinf1P97298 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Serpinf1P97298 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Serpinf1P97298 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Serpinf1P97298 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Serpinf1P97298 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Serpinf1P97298 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Serpinf1P97298 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Serpinf1P97298 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Serpinf1P97298 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Serpinf1P97298 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Serpinf1P97298 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Serpinf1P97298 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Serpinf1P97298 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Serpinf1P97298 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Serpinf1P97298 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Serpinf1P97298 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Serpinf1P97298 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Serpinf1P97298 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Serpinf1P97298 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Serpinf1P97298 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Serpinf1P97298 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Serpinf1P97298 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Serpinf1P97298 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Serpinf1P97298 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Serpinf1P97298 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Serpinf1P97298 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Serpinf1P97298 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Serpinf1P97298 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Serpinf1P97298 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Serpinf1P97298 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Serpinf1P97298 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Serpinf1P97298 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Serpinf1P97298 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Serpinf1P97298 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Serpinf1P97298 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Serpinf1P97298 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Serpinf1P97298 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Serpinf1P97298 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Serpinf1P97298 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Serpinf1P97298 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Serpinf1P97298 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Serpinf1P97298 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Serpinf1P97298 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Serpinf1P97298 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Serpinf1P97298 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Serpinf1P97298 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Serpinf1P97298 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms