Protein–RNA interactions for Protein: P80313

Cct7, T-complex protein 1 subunit eta, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct7P80313 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cct7P80313 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cct7P80313 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cct7P80313 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cct7P80313 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cct7P80313 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cct7P80313 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cct7P80313 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cct7P80313 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cct7P80313 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cct7P80313 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cct7P80313 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cct7P80313 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cct7P80313 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cct7P80313 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cct7P80313 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cct7P80313 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cct7P80313 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cct7P80313 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cct7P80313 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cct7P80313 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cct7P80313 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cct7P80313 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cct7P80313 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cct7P80313 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cct7P80313 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cct7P80313 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cct7P80313 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cct7P80313 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cct7P80313 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cct7P80313 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cct7P80313 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cct7P80313 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cct7P80313 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cct7P80313 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cct7P80313 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cct7P80313 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cct7P80313 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cct7P80313 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cct7P80313 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cct7P80313 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cct7P80313 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cct7P80313 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cct7P80313 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cct7P80313 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cct7P80313 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cct7P80313 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cct7P80313 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cct7P80313 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cct7P80313 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cct7P80313 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cct7P80313 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cct7P80313 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cct7P80313 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cct7P80313 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cct7P80313 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cct7P80313 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cct7P80313 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cct7P80313 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cct7P80313 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cct7P80313 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cct7P80313 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cct7P80313 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cct7P80313 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cct7P80313 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cct7P80313 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cct7P80313 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cct7P80313 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cct7P80313 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cct7P80313 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cct7P80313 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cct7P80313 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cct7P80313 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cct7P80313 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cct7P80313 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cct7P80313 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cct7P80313 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cct7P80313 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cct7P80313 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cct7P80313 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cct7P80313 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cct7P80313 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cct7P80313 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cct7P80313 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cct7P80313 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cct7P80313 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cct7P80313 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cct7P80313 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cct7P80313 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cct7P80313 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cct7P80313 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cct7P80313 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cct7P80313 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cct7P80313 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cct7P80313 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cct7P80313 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cct7P80313 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cct7P80313 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cct7P80313 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cct7P80313 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms