Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcr4P70658 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcr4P70658 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcr4P70658 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxcr4P70658 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxcr4P70658 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxcr4P70658 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxcr4P70658 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxcr4P70658 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxcr4P70658 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxcr4P70658 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxcr4P70658 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxcr4P70658 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxcr4P70658 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxcr4P70658 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxcr4P70658 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcr4P70658 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcr4P70658 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcr4P70658 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcr4P70658 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcr4P70658 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcr4P70658 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcr4P70658 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcr4P70658 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxcr4P70658 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxcr4P70658 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxcr4P70658 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxcr4P70658 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcr4P70658 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcr4P70658 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcr4P70658 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxcr4P70658 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxcr4P70658 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Cxcr4P70658 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cxcr4P70658 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cxcr4P70658 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cxcr4P70658 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcr4P70658 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcr4P70658 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcr4P70658 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcr4P70658 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcr4P70658 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcr4P70658 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcr4P70658 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcr4P70658 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcr4P70658 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcr4P70658 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcr4P70658 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxcr4P70658 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxcr4P70658 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cxcr4P70658 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cxcr4P70658 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cxcr4P70658 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cxcr4P70658 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcr4P70658 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcr4P70658 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cxcr4P70658 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cxcr4P70658 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcr4P70658 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxcr4P70658 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxcr4P70658 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxcr4P70658 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcr4P70658 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcr4P70658 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cxcr4P70658 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcr4P70658 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcr4P70658 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcr4P70658 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcr4P70658 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcr4P70658 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcr4P70658 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcr4P70658 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcr4P70658 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcr4P70658 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcr4P70658 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cxcr4P70658 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cxcr4P70658 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cxcr4P70658 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cxcr4P70658 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcr4P70658 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcr4P70658 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcr4P70658 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcr4P70658 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcr4P70658 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcr4P70658 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcr4P70658 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcr4P70658 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcr4P70658 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcr4P70658 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcr4P70658 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcr4P70658 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcr4P70658 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcr4P70658 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcr4P70658 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcr4P70658 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcr4P70658 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcr4P70658 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcr4P70658 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcr4P70658 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxcr4P70658 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms