Protein–RNA interactions for Protein: P70288

Hdac2, Histone deacetylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac2P70288 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac2P70288 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac2P70288 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac2P70288 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac2P70288 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac2P70288 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac2P70288 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac2P70288 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac2P70288 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac2P70288 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac2P70288 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac2P70288 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac2P70288 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac2P70288 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac2P70288 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac2P70288 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac2P70288 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac2P70288 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac2P70288 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac2P70288 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac2P70288 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac2P70288 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac2P70288 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac2P70288 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac2P70288 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac2P70288 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac2P70288 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac2P70288 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac2P70288 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac2P70288 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac2P70288 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac2P70288 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac2P70288 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac2P70288 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac2P70288 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac2P70288 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac2P70288 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac2P70288 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac2P70288 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac2P70288 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac2P70288 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac2P70288 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac2P70288 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac2P70288 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac2P70288 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac2P70288 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac2P70288 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac2P70288 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac2P70288 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac2P70288 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac2P70288 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac2P70288 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac2P70288 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac2P70288 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac2P70288 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac2P70288 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac2P70288 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac2P70288 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac2P70288 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac2P70288 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac2P70288 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac2P70288 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac2P70288 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac2P70288 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac2P70288 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac2P70288 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac2P70288 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac2P70288 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Hdac2P70288 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Hdac2P70288 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Hdac2P70288 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac2P70288 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac2P70288 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac2P70288 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac2P70288 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac2P70288 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac2P70288 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac2P70288 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac2P70288 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac2P70288 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac2P70288 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac2P70288 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac2P70288 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac2P70288 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac2P70288 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac2P70288 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac2P70288 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac2P70288 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac2P70288 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac2P70288 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac2P70288 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac2P70288 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac2P70288 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac2P70288 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac2P70288 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac2P70288 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac2P70288 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hdac2P70288 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac2P70288 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac2P70288 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms