Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pkn1P70268 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pkn1P70268 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pkn1P70268 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkn1P70268 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkn1P70268 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkn1P70268 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pkn1P70268 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pkn1P70268 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pkn1P70268 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pkn1P70268 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pkn1P70268 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pkn1P70268 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pkn1P70268 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pkn1P70268 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pkn1P70268 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pkn1P70268 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pkn1P70268 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pkn1P70268 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pkn1P70268 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pkn1P70268 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pkn1P70268 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pkn1P70268 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pkn1P70268 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pkn1P70268 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pkn1P70268 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pkn1P70268 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Pkn1P70268 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pkn1P70268 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pkn1P70268 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pkn1P70268 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pkn1P70268 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pkn1P70268 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pkn1P70268 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pkn1P70268 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pkn1P70268 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pkn1P70268 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pkn1P70268 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pkn1P70268 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pkn1P70268 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pkn1P70268 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pkn1P70268 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pkn1P70268 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pkn1P70268 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pkn1P70268 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pkn1P70268 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pkn1P70268 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pkn1P70268 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pkn1P70268 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pkn1P70268 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Pkn1P70268 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pkn1P70268 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pkn1P70268 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pkn1P70268 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pkn1P70268 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pkn1P70268 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pkn1P70268 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pkn1P70268 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pkn1P70268 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pkn1P70268 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pkn1P70268 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pkn1P70268 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Pkn1P70268 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Pkn1P70268 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pkn1P70268 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Pkn1P70268 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pkn1P70268 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pkn1P70268 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pkn1P70268 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pkn1P70268 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pkn1P70268 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pkn1P70268 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pkn1P70268 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pkn1P70268 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pkn1P70268 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pkn1P70268 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pkn1P70268 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pkn1P70268 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pkn1P70268 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pkn1P70268 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pkn1P70268 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pkn1P70268 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pkn1P70268 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pkn1P70268 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pkn1P70268 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pkn1P70268 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pkn1P70268 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pkn1P70268 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pkn1P70268 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Pkn1P70268 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pkn1P70268 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pkn1P70268 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pkn1P70268 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pkn1P70268 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Pkn1P70268 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pkn1P70268 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pkn1P70268 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pkn1P70268 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Pkn1P70268 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pkn1P70268 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms