Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Traf5P70191 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Traf5P70191 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Traf5P70191 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Traf5P70191 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Traf5P70191 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Traf5P70191 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Traf5P70191 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Traf5P70191 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Traf5P70191 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Traf5P70191 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Traf5P70191 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Traf5P70191 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Traf5P70191 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Traf5P70191 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Traf5P70191 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Traf5P70191 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Traf5P70191 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Traf5P70191 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Traf5P70191 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Traf5P70191 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Traf5P70191 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Traf5P70191 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Traf5P70191 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Traf5P70191 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Traf5P70191 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Traf5P70191 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Traf5P70191 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Traf5P70191 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Traf5P70191 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Traf5P70191 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Traf5P70191 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Traf5P70191 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Traf5P70191 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Traf5P70191 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Traf5P70191 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Traf5P70191 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Traf5P70191 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Traf5P70191 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Traf5P70191 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Traf5P70191 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Traf5P70191 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Traf5P70191 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Traf5P70191 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Traf5P70191 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Traf5P70191 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Traf5P70191 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Traf5P70191 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Traf5P70191 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Traf5P70191 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Traf5P70191 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Traf5P70191 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Traf5P70191 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Traf5P70191 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Traf5P70191 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Traf5P70191 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Traf5P70191 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Traf5P70191 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Traf5P70191 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Traf5P70191 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Traf5P70191 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Traf5P70191 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Traf5P70191 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Traf5P70191 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Traf5P70191 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Traf5P70191 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Traf5P70191 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Traf5P70191 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Traf5P70191 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Traf5P70191 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Traf5P70191 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Traf5P70191 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Traf5P70191 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Traf5P70191 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Traf5P70191 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Traf5P70191 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Traf5P70191 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Traf5P70191 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Traf5P70191 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Traf5P70191 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Traf5P70191 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Traf5P70191 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Traf5P70191 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Traf5P70191 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Traf5P70191 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Traf5P70191 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Traf5P70191 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Traf5P70191 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Traf5P70191 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Traf5P70191 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Traf5P70191 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Traf5P70191 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Traf5P70191 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Traf5P70191 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Traf5P70191 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Traf5P70191 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Traf5P70191 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Traf5P70191 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Traf5P70191 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Traf5P70191 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms