Protein–RNA interactions for Protein: P63330

Ppp2ca, Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2caP63330 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp2caP63330 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppp2caP63330 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppp2caP63330 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppp2caP63330 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppp2caP63330 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppp2caP63330 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppp2caP63330 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppp2caP63330 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppp2caP63330 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppp2caP63330 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp2caP63330 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp2caP63330 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp2caP63330 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppp2caP63330 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp2caP63330 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp2caP63330 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp2caP63330 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp2caP63330 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp2caP63330 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp2caP63330 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppp2caP63330 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppp2caP63330 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp2caP63330 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp2caP63330 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp2caP63330 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp2caP63330 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp2caP63330 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp2caP63330 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp2caP63330 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp2caP63330 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp2caP63330 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp2caP63330 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp2caP63330 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp2caP63330 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp2caP63330 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppp2caP63330 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppp2caP63330 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppp2caP63330 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppp2caP63330 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppp2caP63330 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppp2caP63330 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppp2caP63330 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppp2caP63330 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp2caP63330 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp2caP63330 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp2caP63330 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp2caP63330 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp2caP63330 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp2caP63330 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp2caP63330 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp2caP63330 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp2caP63330 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp2caP63330 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp2caP63330 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp2caP63330 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp2caP63330 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp2caP63330 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp2caP63330 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp2caP63330 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp2caP63330 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp2caP63330 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp2caP63330 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp2caP63330 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp2caP63330 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp2caP63330 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp2caP63330 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp2caP63330 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp2caP63330 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp2caP63330 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp2caP63330 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp2caP63330 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp2caP63330 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp2caP63330 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp2caP63330 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp2caP63330 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp2caP63330 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp2caP63330 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp2caP63330 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp2caP63330 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp2caP63330 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp2caP63330 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp2caP63330 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp2caP63330 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp2caP63330 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp2caP63330 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp2caP63330 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp2caP63330 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ppp2caP63330 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp2caP63330 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp2caP63330 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp2caP63330 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp2caP63330 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp2caP63330 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp2caP63330 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp2caP63330 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp2caP63330 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp2caP63330 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp2caP63330 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp2caP63330 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms