Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14,55□□□□□ -0,08
Rps28P62858 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,55□□□□□ -0,08
Rps28P62858 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,54□□□□□ -0,08
Rps28P62858 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14,54□□□□□ -0,08
Rps28P62858 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14,54□□□□□ -0,08
Rps28P62858 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,54□□□□□ -0,08
Rps28P62858 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,54□□□□□ -0,08
Rps28P62858 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,54□□□□□ -0,08
Rps28P62858 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14,54□□□□□ -0,08
Rps28P62858 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,54□□□□□ -0,08
Rps28P62858 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,54□□□□□ -0,08
Rps28P62858 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC14,54□□□□□ -0,08
Rps28P62858 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,54□□□□□ -0,08
Rps28P62858 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,53□□□□□ -0,08
Rps28P62858 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC14,52□□□□□ -0,08
Rps28P62858 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,52□□□□□ -0,08
Rps28P62858 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC14,52□□□□□ -0,09
Rps28P62858 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC14,52□□□□□ -0,09
Rps28P62858 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC14,51□□□□□ -0,09
Rps28P62858 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,51□□□□□ -0,09
Rps28P62858 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,51□□□□□ -0,09
Rps28P62858 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14,51□□□□□ -0,09
Rps28P62858 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,51□□□□□ -0,09
Rps28P62858 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,51□□□□□ -0,09
Rps28P62858 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,51□□□□□ -0,09
Rps28P62858 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,5□□□□□ -0,09
Rps28P62858 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,5□□□□□ -0,09
Rps28P62858 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14,5□□□□□ -0,09
Rps28P62858 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,49□□□□□ -0,09
Rps28P62858 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14,49□□□□□ -0,09
Rps28P62858 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC14,49□□□□□ -0,09
Rps28P62858 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,49□□□□□ -0,09
Rps28P62858 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14,49□□□□□ -0,09
Rps28P62858 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC14,48□□□□□ -0,09
Rps28P62858 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,48□□□□□ -0,09
Rps28P62858 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,48□□□□□ -0,09
Rps28P62858 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC14,48□□□□□ -0,09
Rps28P62858 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14,48□□□□□ -0,09
Rps28P62858 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,47□□□□□ -0,09
Rps28P62858 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,47□□□□□ -0,09
Rps28P62858 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,47□□□□□ -0,09
Rps28P62858 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14,47□□□□□ -0,09
Rps28P62858 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14,47□□□□□ -0,09
Rps28P62858 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,47□□□□□ -0,09
Rps28P62858 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,47□□□□□ -0,09
Rps28P62858 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,46□□□□□ -0,09
Rps28P62858 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,46□□□□□ -0,09
Rps28P62858 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,46□□□□□ -0,09
Rps28P62858 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,46□□□□□ -0,1
Rps28P62858 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14,45□□□□□ -0,1
Rps28P62858 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,45□□□□□ -0,1
Rps28P62858 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,45□□□□□ -0,1
Rps28P62858 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14,44□□□□□ -0,1
Rps28P62858 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,44□□□□□ -0,1
Rps28P62858 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC14,44□□□□□ -0,1
Rps28P62858 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14,43□□□□□ -0,1
Rps28P62858 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,43□□□□□ -0,1
Rps28P62858 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,43□□□□□ -0,1
Rps28P62858 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,42□□□□□ -0,1
Rps28P62858 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC14,42□□□□□ -0,1
Rps28P62858 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14,42□□□□□ -0,1
Rps28P62858 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,42□□□□□ -0,1
Rps28P62858 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14,42□□□□□ -0,1
Rps28P62858 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,42□□□□□ -0,1
Rps28P62858 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,42□□□□□ -0,1
Rps28P62858 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14,42□□□□□ -0,1
Rps28P62858 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,41□□□□□ -0,1
Rps28P62858 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC14,41□□□□□ -0,1
Rps28P62858 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14,41□□□□□ -0,1
Rps28P62858 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,4□□□□□ -0,1
Rps28P62858 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,4□□□□□ -0,1
Rps28P62858 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,4□□□□□ -0,1
Rps28P62858 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,39□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,39□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14,39□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,39□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,39□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,38□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,38□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC14,38□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,38□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,38□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,38□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,38□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,37□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,37□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,37□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,37□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,37□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC14,37□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,36□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,36□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,36□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,36□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,35□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,35□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,35□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,35□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,35□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14,35□□□□□ -0,11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms