Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf13P61216 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf13P61216 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf13P61216 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf13P61216 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf13P61216 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf13P61216 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf13P61216 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf13P61216 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf13P61216 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf13P61216 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf13P61216 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf13P61216 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf13P61216 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf13P61216 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf13P61216 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf13P61216 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf13P61216 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf13P61216 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf13P61216 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf13P61216 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf13P61216 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf13P61216 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf13P61216 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf13P61216 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf13P61216 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf13P61216 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf13P61216 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf13P61216 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf13P61216 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Taf13P61216 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf13P61216 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf13P61216 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf13P61216 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf13P61216 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf13P61216 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf13P61216 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf13P61216 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf13P61216 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf13P61216 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf13P61216 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf13P61216 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf13P61216 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf13P61216 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf13P61216 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf13P61216 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf13P61216 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf13P61216 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf13P61216 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf13P61216 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf13P61216 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf13P61216 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf13P61216 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf13P61216 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf13P61216 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf13P61216 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf13P61216 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Taf13P61216 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Taf13P61216 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf13P61216 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf13P61216 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf13P61216 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf13P61216 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf13P61216 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf13P61216 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf13P61216 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf13P61216 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf13P61216 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf13P61216 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf13P61216 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf13P61216 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf13P61216 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Taf13P61216 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Taf13P61216 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf13P61216 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf13P61216 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf13P61216 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf13P61216 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf13P61216 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf13P61216 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf13P61216 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Taf13P61216 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Taf13P61216 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Taf13P61216 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Taf13P61216 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Taf13P61216 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Taf13P61216 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Taf13P61216 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Taf13P61216 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Taf13P61216 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Taf13P61216 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Taf13P61216 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Taf13P61216 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Taf13P61216 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Taf13P61216 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Taf13P61216 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Taf13P61216 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Taf13P61216 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Taf13P61216 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Taf13P61216 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms