Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2d1P61080 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2d1P61080 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2d1P61080 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2d1P61080 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2d1P61080 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2d1P61080 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2d1P61080 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2d1P61080 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2d1P61080 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2d1P61080 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2d1P61080 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2d1P61080 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2d1P61080 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2d1P61080 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2d1P61080 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2d1P61080 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2d1P61080 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2d1P61080 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2d1P61080 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2d1P61080 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2d1P61080 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2d1P61080 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2d1P61080 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2d1P61080 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2d1P61080 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2d1P61080 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2d1P61080 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2d1P61080 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2d1P61080 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2d1P61080 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2d1P61080 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2d1P61080 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2d1P61080 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2d1P61080 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2d1P61080 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2d1P61080 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube2d1P61080 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube2d1P61080 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2d1P61080 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2d1P61080 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2d1P61080 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2d1P61080 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2d1P61080 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2d1P61080 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2d1P61080 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2d1P61080 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2d1P61080 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2d1P61080 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2d1P61080 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2d1P61080 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2d1P61080 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2d1P61080 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2d1P61080 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2d1P61080 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2d1P61080 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2d1P61080 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2d1P61080 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2d1P61080 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2d1P61080 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2d1P61080 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2d1P61080 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2d1P61080 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2d1P61080 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2d1P61080 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2d1P61080 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2d1P61080 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2d1P61080 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2d1P61080 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2d1P61080 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2d1P61080 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2d1P61080 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2d1P61080 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2d1P61080 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2d1P61080 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2d1P61080 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2d1P61080 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2d1P61080 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2d1P61080 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2d1P61080 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2d1P61080 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2d1P61080 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2d1P61080 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2d1P61080 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2d1P61080 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2d1P61080 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2d1P61080 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2d1P61080 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2d1P61080 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2d1P61080 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2d1P61080 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2d1P61080 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2d1P61080 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2d1P61080 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2d1P61080 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2d1P61080 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2d1P61080 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2d1P61080 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2d1P61080 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2d1P61080 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms