Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcbp1P60335 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcbp1P60335 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcbp1P60335 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcbp1P60335 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcbp1P60335 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcbp1P60335 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcbp1P60335 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcbp1P60335 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcbp1P60335 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcbp1P60335 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcbp1P60335 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcbp1P60335 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcbp1P60335 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcbp1P60335 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcbp1P60335 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcbp1P60335 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcbp1P60335 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcbp1P60335 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcbp1P60335 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcbp1P60335 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcbp1P60335 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcbp1P60335 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcbp1P60335 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pcbp1P60335 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pcbp1P60335 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Pcbp1P60335 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pcbp1P60335 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Pcbp1P60335 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcbp1P60335 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pcbp1P60335 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcbp1P60335 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pcbp1P60335 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcbp1P60335 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcbp1P60335 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcbp1P60335 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcbp1P60335 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcbp1P60335 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcbp1P60335 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcbp1P60335 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcbp1P60335 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcbp1P60335 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcbp1P60335 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcbp1P60335 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pcbp1P60335 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcbp1P60335 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcbp1P60335 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcbp1P60335 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcbp1P60335 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcbp1P60335 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcbp1P60335 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcbp1P60335 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcbp1P60335 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcbp1P60335 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcbp1P60335 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcbp1P60335 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcbp1P60335 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcbp1P60335 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcbp1P60335 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcbp1P60335 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcbp1P60335 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcbp1P60335 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcbp1P60335 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcbp1P60335 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcbp1P60335 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcbp1P60335 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcbp1P60335 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcbp1P60335 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcbp1P60335 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcbp1P60335 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcbp1P60335 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcbp1P60335 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcbp1P60335 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcbp1P60335 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcbp1P60335 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcbp1P60335 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcbp1P60335 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcbp1P60335 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcbp1P60335 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcbp1P60335 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcbp1P60335 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcbp1P60335 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcbp1P60335 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pcbp1P60335 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pcbp1P60335 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pcbp1P60335 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcbp1P60335 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcbp1P60335 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcbp1P60335 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcbp1P60335 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcbp1P60335 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcbp1P60335 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcbp1P60335 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcbp1P60335 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcbp1P60335 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcbp1P60335 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pcbp1P60335 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcbp1P60335 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcbp1P60335 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcbp1P60335 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms