Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hps5P59438 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hps5P59438 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hps5P59438 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hps5P59438 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hps5P59438 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hps5P59438 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hps5P59438 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hps5P59438 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hps5P59438 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hps5P59438 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hps5P59438 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hps5P59438 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hps5P59438 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hps5P59438 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hps5P59438 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hps5P59438 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hps5P59438 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hps5P59438 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hps5P59438 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hps5P59438 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hps5P59438 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hps5P59438 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hps5P59438 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hps5P59438 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hps5P59438 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hps5P59438 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hps5P59438 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hps5P59438 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hps5P59438 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hps5P59438 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hps5P59438 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hps5P59438 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hps5P59438 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hps5P59438 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hps5P59438 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hps5P59438 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hps5P59438 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hps5P59438 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hps5P59438 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hps5P59438 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hps5P59438 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hps5P59438 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hps5P59438 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hps5P59438 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hps5P59438 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hps5P59438 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hps5P59438 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hps5P59438 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hps5P59438 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hps5P59438 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hps5P59438 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hps5P59438 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hps5P59438 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hps5P59438 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hps5P59438 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hps5P59438 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hps5P59438 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hps5P59438 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Hps5P59438 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hps5P59438 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hps5P59438 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hps5P59438 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hps5P59438 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hps5P59438 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hps5P59438 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hps5P59438 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hps5P59438 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hps5P59438 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Hps5P59438 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hps5P59438 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hps5P59438 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hps5P59438 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hps5P59438 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hps5P59438 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hps5P59438 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hps5P59438 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hps5P59438 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hps5P59438 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hps5P59438 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hps5P59438 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hps5P59438 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hps5P59438 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hps5P59438 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hps5P59438 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hps5P59438 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hps5P59438 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hps5P59438 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hps5P59438 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hps5P59438 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hps5P59438 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hps5P59438 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hps5P59438 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hps5P59438 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hps5P59438 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hps5P59438 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hps5P59438 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hps5P59438 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hps5P59438 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hps5P59438 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms