Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtdsplP58465 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtdsplP58465 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtdsplP58465 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtdsplP58465 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtdsplP58465 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtdsplP58465 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtdsplP58465 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CtdsplP58465 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CtdsplP58465 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtdsplP58465 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtdsplP58465 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtdsplP58465 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtdsplP58465 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtdsplP58465 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtdsplP58465 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtdsplP58465 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CtdsplP58465 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtdsplP58465 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtdsplP58465 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtdsplP58465 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtdsplP58465 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtdsplP58465 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtdsplP58465 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtdsplP58465 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CtdsplP58465 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtdsplP58465 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtdsplP58465 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtdsplP58465 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtdsplP58465 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtdsplP58465 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtdsplP58465 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtdsplP58465 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtdsplP58465 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtdsplP58465 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtdsplP58465 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtdsplP58465 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtdsplP58465 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtdsplP58465 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CtdsplP58465 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtdsplP58465 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtdsplP58465 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtdsplP58465 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtdsplP58465 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtdsplP58465 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtdsplP58465 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtdsplP58465 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtdsplP58465 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtdsplP58465 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CtdsplP58465 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CtdsplP58465 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CtdsplP58465 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CtdsplP58465 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtdsplP58465 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtdsplP58465 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtdsplP58465 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtdsplP58465 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtdsplP58465 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtdsplP58465 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtdsplP58465 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtdsplP58465 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtdsplP58465 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtdsplP58465 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtdsplP58465 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtdsplP58465 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtdsplP58465 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtdsplP58465 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtdsplP58465 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtdsplP58465 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CtdsplP58465 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtdsplP58465 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtdsplP58465 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtdsplP58465 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtdsplP58465 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtdsplP58465 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtdsplP58465 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtdsplP58465 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtdsplP58465 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtdsplP58465 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtdsplP58465 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtdsplP58465 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtdsplP58465 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtdsplP58465 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtdsplP58465 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtdsplP58465 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtdsplP58465 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CtdsplP58465 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CtdsplP58465 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CtdsplP58465 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CtdsplP58465 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtdsplP58465 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtdsplP58465 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtdsplP58465 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtdsplP58465 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtdsplP58465 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtdsplP58465 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtdsplP58465 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtdsplP58465 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtdsplP58465 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtdsplP58465 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms