Protein–RNA interactions for Protein: P55821

Stmn2, Stathmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stmn2P55821 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stmn2P55821 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stmn2P55821 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stmn2P55821 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stmn2P55821 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stmn2P55821 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stmn2P55821 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stmn2P55821 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Stmn2P55821 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stmn2P55821 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stmn2P55821 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stmn2P55821 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stmn2P55821 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stmn2P55821 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stmn2P55821 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stmn2P55821 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stmn2P55821 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stmn2P55821 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stmn2P55821 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stmn2P55821 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stmn2P55821 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stmn2P55821 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stmn2P55821 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stmn2P55821 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stmn2P55821 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stmn2P55821 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stmn2P55821 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stmn2P55821 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stmn2P55821 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stmn2P55821 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stmn2P55821 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stmn2P55821 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stmn2P55821 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stmn2P55821 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stmn2P55821 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stmn2P55821 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stmn2P55821 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stmn2P55821 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stmn2P55821 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stmn2P55821 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stmn2P55821 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stmn2P55821 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stmn2P55821 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stmn2P55821 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Stmn2P55821 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Stmn2P55821 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Stmn2P55821 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Stmn2P55821 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Stmn2P55821 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stmn2P55821 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stmn2P55821 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stmn2P55821 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stmn2P55821 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stmn2P55821 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stmn2P55821 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stmn2P55821 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stmn2P55821 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stmn2P55821 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stmn2P55821 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stmn2P55821 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stmn2P55821 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stmn2P55821 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stmn2P55821 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stmn2P55821 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stmn2P55821 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stmn2P55821 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stmn2P55821 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stmn2P55821 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stmn2P55821 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stmn2P55821 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stmn2P55821 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stmn2P55821 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stmn2P55821 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stmn2P55821 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stmn2P55821 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stmn2P55821 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stmn2P55821 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stmn2P55821 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stmn2P55821 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stmn2P55821 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stmn2P55821 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stmn2P55821 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stmn2P55821 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stmn2P55821 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stmn2P55821 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stmn2P55821 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stmn2P55821 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stmn2P55821 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stmn2P55821 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stmn2P55821 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stmn2P55821 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stmn2P55821 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stmn2P55821 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stmn2P55821 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Stmn2P55821 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stmn2P55821 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stmn2P55821 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Stmn2P55821 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stmn2P55821 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Stmn2P55821 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms