Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sh3bp1P55194 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sh3bp1P55194 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sh3bp1P55194 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sh3bp1P55194 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sh3bp1P55194 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sh3bp1P55194 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sh3bp1P55194 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sh3bp1P55194 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sh3bp1P55194 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sh3bp1P55194 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sh3bp1P55194 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sh3bp1P55194 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sh3bp1P55194 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sh3bp1P55194 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sh3bp1P55194 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sh3bp1P55194 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sh3bp1P55194 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sh3bp1P55194 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sh3bp1P55194 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sh3bp1P55194 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sh3bp1P55194 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sh3bp1P55194 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sh3bp1P55194 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sh3bp1P55194 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sh3bp1P55194 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Sh3bp1P55194 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sh3bp1P55194 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sh3bp1P55194 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sh3bp1P55194 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sh3bp1P55194 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sh3bp1P55194 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sh3bp1P55194 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Sh3bp1P55194 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sh3bp1P55194 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sh3bp1P55194 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sh3bp1P55194 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sh3bp1P55194 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sh3bp1P55194 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sh3bp1P55194 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Sh3bp1P55194 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sh3bp1P55194 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sh3bp1P55194 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sh3bp1P55194 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sh3bp1P55194 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sh3bp1P55194 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sh3bp1P55194 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sh3bp1P55194 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sh3bp1P55194 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sh3bp1P55194 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sh3bp1P55194 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sh3bp1P55194 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sh3bp1P55194 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sh3bp1P55194 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sh3bp1P55194 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sh3bp1P55194 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sh3bp1P55194 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sh3bp1P55194 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sh3bp1P55194 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sh3bp1P55194 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh3bp1P55194 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh3bp1P55194 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh3bp1P55194 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh3bp1P55194 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sh3bp1P55194 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sh3bp1P55194 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Sh3bp1P55194 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sh3bp1P55194 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sh3bp1P55194 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sh3bp1P55194 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sh3bp1P55194 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sh3bp1P55194 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sh3bp1P55194 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh3bp1P55194 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh3bp1P55194 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh3bp1P55194 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh3bp1P55194 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sh3bp1P55194 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sh3bp1P55194 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Sh3bp1P55194 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sh3bp1P55194 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sh3bp1P55194 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sh3bp1P55194 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sh3bp1P55194 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sh3bp1P55194 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh3bp1P55194 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh3bp1P55194 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh3bp1P55194 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sh3bp1P55194 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sh3bp1P55194 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh3bp1P55194 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh3bp1P55194 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh3bp1P55194 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh3bp1P55194 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh3bp1P55194 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh3bp1P55194 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh3bp1P55194 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sh3bp1P55194 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sh3bp1P55194 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sh3bp1P55194 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms