Protein–RNA interactions for Protein: P50708

Defa10, Alpha-defensin 10, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa10P50708 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa10P50708 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Defa10P50708 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Defa10P50708 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa10P50708 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa10P50708 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa10P50708 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa10P50708 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa10P50708 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa10P50708 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa10P50708 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa10P50708 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa10P50708 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa10P50708 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa10P50708 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa10P50708 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa10P50708 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa10P50708 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa10P50708 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa10P50708 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Defa10P50708 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa10P50708 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa10P50708 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa10P50708 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa10P50708 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa10P50708 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa10P50708 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa10P50708 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa10P50708 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa10P50708 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa10P50708 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa10P50708 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa10P50708 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa10P50708 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa10P50708 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa10P50708 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa10P50708 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa10P50708 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa10P50708 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa10P50708 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa10P50708 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa10P50708 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa10P50708 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa10P50708 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa10P50708 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa10P50708 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa10P50708 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa10P50708 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa10P50708 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa10P50708 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa10P50708 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa10P50708 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa10P50708 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa10P50708 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa10P50708 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa10P50708 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa10P50708 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa10P50708 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa10P50708 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa10P50708 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa10P50708 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa10P50708 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa10P50708 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa10P50708 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa10P50708 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa10P50708 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa10P50708 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa10P50708 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa10P50708 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa10P50708 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa10P50708 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa10P50708 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa10P50708 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa10P50708 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa10P50708 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa10P50708 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa10P50708 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa10P50708 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa10P50708 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa10P50708 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa10P50708 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa10P50708 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa10P50708 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa10P50708 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa10P50708 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa10P50708 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa10P50708 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa10P50708 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa10P50708 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa10P50708 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa10P50708 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa10P50708 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa10P50708 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa10P50708 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa10P50708 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa10P50708 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa10P50708 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa10P50708 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa10P50708 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa10P50708 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms