Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atoh1P48985 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atoh1P48985 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atoh1P48985 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Atoh1P48985 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atoh1P48985 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Atoh1P48985 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atoh1P48985 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atoh1P48985 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atoh1P48985 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atoh1P48985 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atoh1P48985 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atoh1P48985 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atoh1P48985 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atoh1P48985 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atoh1P48985 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atoh1P48985 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atoh1P48985 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atoh1P48985 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atoh1P48985 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Atoh1P48985 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atoh1P48985 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Atoh1P48985 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atoh1P48985 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atoh1P48985 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atoh1P48985 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atoh1P48985 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atoh1P48985 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atoh1P48985 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atoh1P48985 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atoh1P48985 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atoh1P48985 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atoh1P48985 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Atoh1P48985 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atoh1P48985 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atoh1P48985 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Atoh1P48985 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Atoh1P48985 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atoh1P48985 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atoh1P48985 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Atoh1P48985 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Atoh1P48985 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atoh1P48985 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atoh1P48985 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atoh1P48985 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atoh1P48985 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atoh1P48985 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atoh1P48985 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atoh1P48985 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Atoh1P48985 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atoh1P48985 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atoh1P48985 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atoh1P48985 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atoh1P48985 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atoh1P48985 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atoh1P48985 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atoh1P48985 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Atoh1P48985 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atoh1P48985 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atoh1P48985 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Atoh1P48985 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atoh1P48985 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atoh1P48985 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Atoh1P48985 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atoh1P48985 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atoh1P48985 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atoh1P48985 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atoh1P48985 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Atoh1P48985 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Atoh1P48985 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atoh1P48985 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atoh1P48985 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atoh1P48985 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atoh1P48985 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atoh1P48985 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Atoh1P48985 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atoh1P48985 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atoh1P48985 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atoh1P48985 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atoh1P48985 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atoh1P48985 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atoh1P48985 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atoh1P48985 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atoh1P48985 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atoh1P48985 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Atoh1P48985 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atoh1P48985 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atoh1P48985 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atoh1P48985 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atoh1P48985 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atoh1P48985 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Atoh1P48985 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atoh1P48985 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atoh1P48985 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atoh1P48985 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atoh1P48985 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atoh1P48985 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atoh1P48985 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Atoh1P48985 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atoh1P48985 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms