Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Edn3P48299 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Edn3P48299 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Edn3P48299 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Edn3P48299 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Edn3P48299 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edn3P48299 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edn3P48299 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edn3P48299 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edn3P48299 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edn3P48299 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edn3P48299 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edn3P48299 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edn3P48299 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Edn3P48299 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Edn3P48299 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Edn3P48299 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Edn3P48299 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Edn3P48299 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Edn3P48299 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Edn3P48299 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Edn3P48299 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Edn3P48299 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Edn3P48299 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Edn3P48299 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Edn3P48299 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Edn3P48299 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Edn3P48299 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Edn3P48299 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Edn3P48299 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Edn3P48299 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Edn3P48299 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Edn3P48299 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Edn3P48299 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Edn3P48299 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Edn3P48299 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Edn3P48299 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Edn3P48299 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Edn3P48299 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Edn3P48299 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Edn3P48299 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edn3P48299 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edn3P48299 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Edn3P48299 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edn3P48299 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edn3P48299 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Edn3P48299 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Edn3P48299 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edn3P48299 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edn3P48299 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edn3P48299 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Edn3P48299 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Edn3P48299 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edn3P48299 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edn3P48299 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edn3P48299 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edn3P48299 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edn3P48299 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edn3P48299 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edn3P48299 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edn3P48299 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edn3P48299 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edn3P48299 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edn3P48299 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edn3P48299 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edn3P48299 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Edn3P48299 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Edn3P48299 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Edn3P48299 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Edn3P48299 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Edn3P48299 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Edn3P48299 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Edn3P48299 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Edn3P48299 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Edn3P48299 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Edn3P48299 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Edn3P48299 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Edn3P48299 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Edn3P48299 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Edn3P48299 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Edn3P48299 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Edn3P48299 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Edn3P48299 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Edn3P48299 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Edn3P48299 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Edn3P48299 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Edn3P48299 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Edn3P48299 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Edn3P48299 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Edn3P48299 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Edn3P48299 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Edn3P48299 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Edn3P48299 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Edn3P48299 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Edn3P48299 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Edn3P48299 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Edn3P48299 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Edn3P48299 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Edn3P48299 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Edn3P48299 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms